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Logros de Nuestra Comunidad

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2024
Filtrando por
Informes de gestión
Producción científica
Vinculación tecnológica
Cursos para la Comunidad
Tesis de Doctorado
Tesis de Maestría
Trabajos Finales y Tesinas

2024 Producción científica

  1. S.L. Gallino, L. Agüero, J.C. Boffi, G. Schottlender, P. Buonfiglio, V. Dalamon, I. Marcovich, A. Carpaneto, P.O. Craig, P.V. Plazas, A.B. Elgoyhen. «Key role of the TM2-TM3 loop in calcium potentiation of the α9α10 nicotinic acetylcholine receptor.» Cellular and Molecular Life Sciences 81.1 (2024): 337.
    DOI: 10.1007/s00018-024-05381-2.
  2. D.A. Caraballo, M.L. Vico, M.G. Piccirilli, S.M. Hirmas Riade, S. Russo, G. Martínez, F.J. Beltrán, D.M. Cisterna. «Bat Rabies in the Americas: Is Myotis the Main Ancestral Spreader?.» Viruses (2024), 16(8), 1302.
    DOI: 10.3390/v16081302.
  3. M.A. Velasquez, R.P. Chambi, M.A. Argoitia, P. Schierloh, M.G. Piccirilli, V.C. Colombo, F.J. Beltrán, D.M. Cisterna, D.A. Caraballo. «Revisiting Molossus (Mammalia: Chiroptera: Molossidae) diversity: Exploring southern limits and revealing a novel species in Argentina.» Vertebrate Zoology 74 (2024): 397-416.
    DOI: 10.3897/vz.74.e122822.
  4. J.P. Cerutti, L.A. Diniz, V. Corrêa Santos, S.C. Vilchez Larrea, G.D. Alonso, R. Salgado Ferreira, W. Dehaen, M.A. Quevedo. «Structure-Aided Computational Design of Triazole-Based Targeted Covalent Inhibitors of Cruzipain.» Molecules 29.17 (2024): 4224.
    DOI: 10.3390/molecules29174224.
  5. J. Salas, A.L. Cardona, M.A. Paci, F.E. Malanca. «Trifluoroacetyl peroxynitrate (CF3C (O) O2NO2, FPAN) degradation in wet atmosphere.» Atmospheric Environment 337 (2024): 120780.
    DOI: 10.1016/j.atmosenv.2024.120780.
  6. E. Kabat, A.Y. Ramos, L.J. Fernández-Alcázar, T. Kottos. «Nonlinear defect theory of thermal relaxation in complex multimoded systems.» Physical Review Research 6.3 (2024): 033114.
    DOI: 10.1103/PhysRevResearch.6.033114.
  7. F.A. Soria, P. Siani, C. Di Valentin. «Nature of TiO2–oligonucleotides interactions by atomistic molecular dynamics simulations.» Surfaces and Interfaces 52 (2024): 104889.
    DOI: 10.1016/j.surfin.2024.104889.
  8. J.A. Vila, G.N. Rimondino, W.J. Peláez, M. Kalinowski, F.E. Malanca. «Atmospheric photo-oxidation of acetic anhydride: Kinetic study and reaction mechanism. Products distribution and fate of CH3C (O) OC (O) CH2O· radical.» Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry 458 (2024): 115937.
    DOI: 10.1016/j.jphotochem.2024.115937.
  9. J.L. Nuñez, E. Colombo, I. Tranca, D. Bazin, P. Quaino, F. Tielens. «Understanding the Atomistic Behavior of Small Molecules (O2 and N2) on Monometallic M13 Nanoparticles.» Available at SSRN 4821665.
    DOI: 10.2139/ssrn.4821665.
  10. A.L. Cardona, M. Teruel, O.N. Ventura. «Unexpected high yield of acrolein underlies the importance of the hydrogen-abstraction mechanism in photooxidation of allyl methyl sulfide (AMS).» Chemosphere 354 (2024): 141693.
    DOI: 10.1016/j.chemosphere.2024.141693.
  11. A. Kurnosov, L.J. Fernández-Alcázar, A. Ramos, B. Shapiro, T. Kottos. «Optical Kinetic Theory of Nonlinear Multimode Photonic Networks.» Physical Review Letters 132.19 (2024): 193802. (Sugerencia del Editor).
    DOI: 10.1103/PhysRevLett.132.193802.
  12. L.S. Mayorga, D. Masone. «The Secret Ballet Inside Multivesicular Bodies.» ACS nano (2024). (ACS-nano press-release).
    DOI: 10.1021/acsnano.4c01590.
    Divulgación
    CONICET.
  13. R.G. Parra, M.I. Freiberger, M. Poley-Gil, M. Fernandez-Martin, L.G. Radusky, V. Ruiz-Serra, P.G. Wolynes, D.U. Ferreiro, A. Valencia. «Frustraevo: a web server to localize and quantify the conservation of local energetic frustration in protein families.» Nucleic Acids Research (2024): gkae244.
    DOI: 10.1093/nar/gkae244.
  14. J. Brizuela, M.V. Bracamonte, D.E. Barraco, M. Otero. «First principles investigation of LIXSI and LIXSN alloys: unraveling atomic-scale influences on material properties.» Journal of Power Sources 609 (2024): 234657.
    DOI: 10.1016/j.jpowsour.2024.234657.
  15. F.E. Lurgo, R.D. Sánchez, R.E. Carbonio, O.V. Billoni. «Magnetic hysteresis mechanism in Lu0. 9Sr0. 1Cr0. 5Fe0. 5O3 studied by Monte Carlo simulations.» Journal of Physics: Condensed Matter 36.32 (2024): 325804.
    DOI: 10.1088/1361-648X/ad475d.
  16. P.E. Colazo, F. Stasyszyn, N. Padilla. «Structure formation with primordial black holes to alleviate early star formation tension revealed by JWST.» Astronomy & Astrophysics 685 (2024): L8.
    DOI: 10.1051/0004-6361/202449565.
  17. C. Bellino, F.E. Herrera, D. Rodrigues, A.S. Garay, S.V. Huck, R. Reinheimer. «Molecular Evolution of RAMOSA1 (RA1) in Land Plants.» Biomolecules 14.5 (2024): 550.
    DOI: 10.3390/biom14050550.
  18. J.C. Jiménez-García, D.F.R. Flores,R.H. Acosta, M.I. Velasco, E.A. Franceschini, M.M. Mariscal. «Water behavior at PEMFC triple phase boundary: Exploring ionomer and catalytic layer effects via molecular dynamic simulations and NMR experiments.» International Journal of Hydrogen Energy 52 (2024): 65-71.
    DOI: 10.1016/j.ijhydene.2023.10.097.
  19. A. Gayol, R. Figueroa, J. Guarda, J. Leiva, F. Leyton, F. Malano, M. Valente. «Effects on the accelerating electron bunches due to the presence of sulfur hexafluoride or air in the linac waveguide.» Applied Radiation and Isotopes 205 (2024): 111155.
    DOI: 10.1016/j.apradiso.2023.111155.
  20. D.K. Jacquelín, F.A. Soria, P.A. Paredes-Olivera, E.M. Patrito. «Host-guest dynamics in porous trimesic acid supramolecular network on graphene. Outstanding stability of the coronene guest.» Carbon 217 (2024): 118643.
    DOI: 10.1016/j.carbon.2023.118643.
  21. R.S. Meleán Brito, J. Milanesio, M.B. Oviedo, J.M. Padró, M.C. Strumia, F. Mattea. «Tannic Acid-Modified Poly (acrylamide-co-acrylic acid): A Versatile Approach for Aqueous Viscosity Modulation.» ACS Applied Polymer Materials 6.8 (2024): 4462-4474.
    DOI: 10.1021/acsapm.3c03056.
  22. C.A. Giuppone, L.V. Gramajo, E. Gianuzzi, M.N. Ramos, N. Cuello, T.C. Hinse. «Unveiling hidden companions in post-common-envelope binaries: A robust strategy and uncertainty exploration.» Astronomy & Astrophysics 683 (2024): A129.
    DOI: 10.1051/0004-6361/202347030.
  23. F. Bucher, L.B. Monachesi, G.A. Castromán, F.I. Zyserman. «Seismoelectric response of 2-D elastic/poroelastic coupled media: a phenomenological approach.» Geophysical Journal International 236.1 (2024): 62-77.
    DOI: 10.1093/gji/ggad418.
  24. I.J. Chevallier-Boutell, R.H. Acosta, M.B. Franzoni, J.A. Olmos-Asar. «Coverage-dependent adsorption of n-hexane and isopropanol on silica: A density-functional study.» Microporous and Mesoporous Materials 375 (2024): 113174.
    DOI: 10.1016/j.micromeso.2024.113174.
  25. G. Belletti, L. Goncebat, W. Schmickler, E. Colombo, P. Quaino. «Pt-based graphene quantum dots for water dissociation.» Journal of Physics: Condensed Matter (2024).
    DOI: 10.1088/1361-648X/ad577e.
  26. A.L. Di Bartolo, M. Caparotta, L.M Polo, D. Masone. «Myomerger Induces Membrane Hemifusion and Regulates Fusion Pore Expansion». Biochemistry (2024): 63 (6), 815-826
    DOI: 10.1021/acs.biochem.3c00682.
    Divulgación
    CONICET.
  27. M.L. Costantino, M. Lavecchia, M.L. Fascio, M.L. Lastra, M.D. Contin, N.B. D’Accorso. «Synthesis and supramolecular behaviour study of a novel amphiphilic compound for idebenone encapsulation.» Journal of Molecular Structure (2024): 137936.
    DOI: 10.1016/j.molstruc.2024.137936.
  28. F.R. Pantano, M.I. Rojas. «First-principles studies of melem/carbonaceous interfaces.» Computational Materials Science 237 (2024): 112883.
    DOI: 10.1016/j.commatsci.2024.112883.
  29. K.I. Sánchez, H. Recknagel, K.R. Elmer, L.J. Avila, M. Morando. «Tracing evolutionary trajectories in the presence of gene flow in South American temperate lizards (Squamata: Liolaemus kingii group).» Evolution (2024): qpae009.
    DOI: 10.1093/evolut/qpae009.
  30. B. Lowe, A.L. Cardona, J. Salas, A. Bodi, P.M. Mayer, M.A. Burgos Paci. «What a difference a chlorine makes: The remarkable unimolecular ion chemistry of phenyl formate and phenyl chloroformate.» Journal of Mass Spectrometry 59.2 (2024): e5004.
    DOI: 10.1002/jms.5004.
  31. F.P. Cometto, N. Arisnabarreta, R. Vanta, D.K. Jacquelín, V. Vyas, B.V. Lotsch, …, M. Lingenfelder. «Rational Design of 2D Supramolecular Networks Switchable by External Electric Fields.» ACS nano (2024).
    DOI: 10.1021/acsnano.3c09775.
  32. A.M. Rodríguez-Medrano, V. Springel, F.A. Stasyszyn, D.J. Paz. «The evolutionary path of void galaxies in TNG300 simulation.» Monthly Notices of the Royal Astronomical Society 528.2 (2024): 2822-2833.
    DOI: 10.1093/mnras/stae193.
  33. M.P. Howard, P.M. Miura-Akagi, T.W. Chapp, Y.J. Ah-Tye, T. Kitano, D.Y. Zhou, …, M.F. Cain. «Synthesis and reactivity of a PH functionalized benzazaphosphole.» Polyhedron (2024): 116905.
    DOI: 10.1016/j.poly.2024.116905.
  34. E.J. Gonzalez, A. Rodríguez-Medrano, L. Pereyra, D. García Lambas. «Cluster halo shapes in CDM and SIDM models: unveiling the DM particle nature using a weak-lensing approach.» Monthly Notices of the Royal Astronomical Society 528.2 (2024): 3075-3091.
    DOI: 10.1093/mnras/stae099.

2024 Tesis de Doctorado

  1. J. Pelle. «Aplicaciones de transporte radiactivo relativista a la astrofísica de estrellas de neutrones y objetos compactos exóticos» Tesis Doctoral en Astronomía, FAMAF-UNC. Dirección: Oscar Reula.

2024 Trabajos Finales y Tesinas

  1. A. Rinaldi, A. Bibiloni Lombardi, C. Salas y J.P. Marshall, «Comparación de lenguajes de programación para la práctica de la ciencia de datos» Trabajo Final de Ingeniería en Informática, Facultad de Ingeniería UBA. Dirección: Rosita Wachenchauzer y Gastón Martinez.
  2. A. Civini, E. Foppiano, F. Mastricchio y N. Zulaica Rivera, «Análisis de lenguajes para sistemas concurrentes» Trabajo Final de Ingeniería en Informática, Facultad de Ingeniería UBA. Dirección: Rosita Wachenchauzer y Ariel Scarpinelli.
  3. M. Abrudsky. «Transporte de radiación en espacio-tiempos de alta curvatura» Trabajo Final de Licenciatura en Física, FAMAF-UNC. Dirección: Federico Carrasco.

2023

Informe de Gestión 2023

2023 Producción científica

  1. V. Scardino, J.I. Di Filippo, C.N. Cavasotto. «How good are AlphaFold models for docking-based virtual screening?.» Iscience 26.1 (2023). DOI: 10.1016/j.isci.2022.105920.
  2. M.I. Freiberger, V. Ruiz-Serra, C. Pontes, M. Romero-Durana, P. Galaz-Davison, C.A. Ramírez-Sarmiento, C.D. Schuster, M.A. Marti, P.G. Wolynes, D.U. Ferreiro, R.G. Parra. «Local energetic frustration conservation in protein families and superfamilies.» Nature Communications 14, no. 1 (2023): 8379. DOI: 10.1038/s41467-023-43801-2.
  3. P. Serra, W.G. Dantas y J.F. Stilck. «Semi‐flexible Trimers on the Square Lattice in the Full Lattice Limit.» Brazilian Journal of Physics 53, 72 (2023). DOI: 10.1007/s13538-023-01288-8.
  4. A.M. Rodríguez-Medrano, D.J. Paz, F.A. Stasyszyn, F. Rodríguez, A.N. Ruiz, M. Merchán. «Local and large-scale effects on the astrophysics of void galaxies.» Monthly Notices of the Royal Astronomical Society 521, no. 1 (2023): 916-925. DOI: 10.1093/mnras/stad623.
  5. F. Dávila-Kurbán, A.N. Ruiz, D.J. Paz, D. Garcia Lambas. «Void probability function inside cosmic voids: evidence for hierarchical scaling of high-order correlations in real space.» Monthly Notices of the Royal Astronomical Society (2023): stad3644. DOI: 10.1093/mnras/stad3644.
  6. D.J. Paz, C.M. Correa, S.R. Gualpa, A.N. Ruiz, C.S. Bederián, R.D. Graña, N.D. Padilla. «Guess the cheese flavour by the size of its holes: A cosmological test using the abundance of popcorn voids.» Monthly Notices of the Royal Astronomical Society 522, no. 2 (2023): 2553-2569. DOI: 10.1093/mnras/stad1146.
  7. G.L. Borosky, K.K. Laali. «Gauging the Aromatic, Antiaromatic, and Nonaromatic Character of the Dications and Dianions Derived from Fused Carbocyclic and Heterocyclic Compounds.» ChemistrySelect 8, no. 48 (2023): e202303274. DOI: 10.1002/slct.202303274.
  8. G.J. Olguin-Orellana, J.A. de la Rosa Abad, M.B. Camarada, S. Mejia-Rosales, J. Alzate-Morales, M.M. Mariscal. «On the mechanical response of graphene-capped copper nanoparticles.» Physical Chemistry Chemical Physics (2024). DOI: 10.1039/D3CP05273G.
  9. M.I. Rojas, D.V. Centellas, O.E. Linarez Pérez, L.B. Avalle. «A comprehensive study of Indole adsorption on highly oriented pyrolytic graphite.» Carbon 202 (2023): 475-486. DOI: 10.1016/j.carbon.2022.11.016.
  10. F.J. Cerino, A. Diaz-Pace, E.A. Tassone, M. Tiglio, A. Villegas. «Hyperparameter Optimization of an hp-Greedy Reduced Basis for Gravitational Wave Surrogates.» Universe 10, no. 1 (2023): 6. DOI: 10.3390/universe10010006.
  11. P.E. Colazo, A.N. Ruiz, F. Stasyszyn, N.D. Padilla. «Simulaciones de fluctuaciones no lineales en eras tempranas del Universo.» Boletin de la Asociacion Argentina de Astronomia La Plata Argentina 64 (2023): 241-243.
  12. A. Gayol, R. Figueroa, J. Guarda, J. Leiva, F. Leyton, F. Malano, M. Valente. «Effects on the accelerating electron bunches due to the presence of sulfur hexafluoride or air in the linac waveguide.» Applied Radiation and Isotopes (2023): 111155. DOI: 10.1016/j.apradiso.2023.111155.
  13. A.C. Dassie, R.M. Id Betan. «α-decay from Ti 44: A study of microscopic clusterization.» Physical Review C 108.4 (2023): 044314. DOI: 10.1103/PhysRevC.108.044314.
  14. A.B. Kolton, E.E. Ferrero, A. Rosso. «Depinning free of the elastic approximation.» Physical Review B 108 (2023): 174201. DOI: 10.1103/PhysRevB.108.174201.
  15. B. Lowe, A.L. Cardona, A. Bodi, P.M. Mayer, M.A. Burgos Paci. «The Unimolecular Chemistry of Methyl Chloroformate Ions and Neutrals: A Story of Near-Threshold Decomposition.» Journal of the American Society for Mass Spectrometry (2023). DOI: 10.1021/jasms.3c00334.
  16. D. Furman, P. Torres, J. Rodríguez, D. Letzen, M. Martinez, L. Alemany. «High-quality argumentative information in low resources approaches improve counter-narrative generation.» Findings of the Association for Computational Linguistics: EMNLP 2023 (2023). DOI: 10.18653/v1/2023.findings-emnlp.194.
  17. J.M. Perez, M. Rajngewerc, J.C. Giudici, D.A. Furman, F. Luque, L.A. Alemany, M.V. Martínez. «pysentimiento: A Python Toolkit for Opinion Mining and Social NLP tasks.» (2023). DOI: 10.21203/rs.3.rs-3570648/v1.
  18. J.C. Jiménez-García, D.F. Flores, R.H. Acosta, M.I. Velasco, E.A. Franceschini, M.M. Mariscal. «Water behavior at PEMFC triple phase boundary: Exploring ionomer and catalytic layer effects via molecular dynamic simulations and NMR experiments.» International Journal of Hydrogen Energy (2023). DOI: 10.1016/j.ijhydene.2023.10.097.
  19. D.K. Jacquelín, F.A. Soria, P.A. Paredes-Olivera, E.M. Patrito. «Host-guest dynamics in porous trimesic acid supramolecular network on graphene. Outstanding stability of the coronene guest.» Carbon (2023): 118643. DOI: 10.1016/j.carbon.2023.118643.
  20. F. Bucher, L.B. Monachesi, G.A. Castromán, F.I. Zyserman. «Seismoelectric response of 2-D elastic/poroelastic coupled media: a phenomenological approach.» Geophysical Journal International 236.1 (2024): 62-77. DOI: 10.1093/gji/ggad418.
  21. J.M. Casañas, P.M. Cometto, M.G. Vera, M. Córdoba. «Geostatistical analysis of the relationship among geomorphology, land cover, and AOD at the local scale in a South American desert region.» Atmospheric Pollution Research 14.11 (2023): 101909. DOI: 10.1016/j.apr.2023.101909.
  22. B. Lai, S. Liu, J. Cahir, Y. Sun, H. Yin, T. Youngs, J. Tan, S.F. Fonrouge, M.G. Del Pópolo, J.L. Borioni, D.E. Crawford, F.M. Alexander, C. Li, S.E. Bell, B. Murrer, S.L. James. «Liquids with high compressibility.» Advanced Materials (2023): 2306521. DOI: 10.1002/adma.202306521.
    Divulgación
    Nature, CONICET, CCAD.
  23. M. Rinaldi Tosi, V. Palermo, F. Giannini, M. Fernández-Baldo, J. Diaz, B. Lima, G. Feresin, G. Romanelli, H.A. Baldoni. «N‐Sulfonyl‐1,2,3,4‐tetrahydroisoquinoline Derivatives: Synthesis, Antimicrobial Evaluations, and Theoretical Insights.» Chemistry & Biodiversity (2023), e202300905. DOI: 10.1002/cbdv.202300905.
  24. F. Fernandez, M. Otero, M.B. Oviedo, D.E. Barraco, S.A. Paz, E.P. Leiva. «NMR, x-ray, and Mössbauer results for amorphous Li-Si alloys using density functional tight-binding method.» Physical Review B 108.14 (2023): 144201. DOI: 10.1103/PhysRevB.108.144201.
  25. A. Ruderman, M.B. Oviedo, S.A. Paz, E.P. Leiva. «Diversity of Behavior after Collisions of Sn and Si Nanoparticles Found Using a New Density Functional Tight-Binding Method.» The Journal of Physical Chemistry A (2023). DOI: 10.1021/acs.jpca.3c05534.
  26. F.J. García-Soriano, S.A. Ceppi, F.P Cometto, E.N. Primo, D.E. Barraco, E.P. Leiva, G.L. Luque, G. Stutz, G. Lener, M.V. Bracamonte. «Sepiolite as a novel polysulfide trapper for energy applications: an electrochemical, X-ray spectroscopic and DFT study.» Physical Chemistry Chemical Physics 25.36 (2023): 24761-24769. DOI: 10.1039/D3CP03157H.
  27. R.T. Müller, M.D. Ezcurra, M.S. Garcia, F.L. Agnolín, M.R. Stocker, F.E. Novas, M.B. Soares, A.W. Kellner, S.J. Nesbitt. «New reptile shows dinosaurs and pterosaurs evolved among diverse precursors.» Nature 620, no. 7974 (2023): 589-594 (artículo de tapa). DOI: 10.1038/s41586-023-06359-z.
    Divulgación
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  28. M. Cécere, A. Costa, T. Van Doorsselaere, «Modulation depth of the gyrosynchrotron emission as an identifier of fundamental sausage modes.» Astronomy&Astrophysics 676 A8 (2023). DOI: 10.1051/0004-6361/202346746.
  29. L.D. Mena, J.L. Borioni, S. Caby, P. Enders, M.A. Argüello Cordero, F. Fennel, R. Francke, S. Lochbrunner, J.I. Bardagi. «Quantitative prediction of excited-state decay rates for radical anion photocatalysts.» Chemical Communications 59, no. 64 (2023): 9726-9729. DOI: 10.1039/d3cc02534a.
  30. M.S. Faillace, N.M. Ceballos, N.B. Shustova, W.J. Peláez. «Selective Synthesis using ETFBO: A New Strategy for the Preparation of Hexahydro‐1H‐pyrrolo [1, 2‐c] imidazol‐1‐one.» Asian Journal of Organic Chemistry (2023): e202300318. DOI: 10.1002/ajoc.202300318.
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  32. P. Serra, W.G. Dantas, J.F. Stilck. «Semi-flexible trimers on the square lattice in the full lattice limit.» Brazilian Journal of Physics 53, no. 3 (2023): 72. DOI: 10.1007/s13538-023-01288-8.
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  57. R. Comelli, E. Kofman, C. Bederian, N. Wolovick, «Control predictivo basado en modelo con entrada finita para seguimiento de camino acelerado con GPU.» MACI 2023: IX Congreso de Matemática Aplicada, Computacional e Industrial.

2023 Cursos para la Comunidad

  1. «Observabilidad en Kubernetes», el lunes 6 de noviembre el CTO de DC Solutions, el Ing. Fernando Gleiser mostró como utilizar eBPF para diagnosticar problemas en el orquestador de contenedores.
    Video, Slides.
  2. «Como domestiqué al perro, un CS en Mendieta F2», el martes 17 de octubre el tesista de la Lic. en Cs. de la Computación Nicolas Hörmann nos cuenta como trasladó su workload de machine learning de un server con GPUs y Linux (Nabu1 y 2) a un cluster de GPUs (MendietaF2), y así pasó de una pesadilla de out-of-memory, no space left on disk, cannot install package, a un entorno productivo, repetible, estable y escalable.
    Video, Slides.

2023 Tesis de Doctorado

  1. P. López, «Momento angular y dinámica interna de halos de materia oscura» Tesis Doctoral en Astronomía, FAMAF-UNC. Dirección: Dr. Manuel Merchán.
  2. M.M. Abbate, «Estudio de mecanismos moleculares involucrados en el desarrollo y progresión de la leucemia linfoblástica aguda en pediatría» Tesis Doctoral en Química Biológica, FCEN-UBA. Dirección: Dr. Javier Cotignola.
  3. G.J. Olguín-Orellana, «Rational design of graphene-coated copper nanoparticles to study their thermal and mechanical proparties» Tesis Doctoral en ciencias: especialización en modelado de sistemas químicos y biológicos, Universidad de Talca (Chile). Dirección: Dr. María Belén Camarada, Dr. Jans Alzate-Morales y Dr. Marcelo Mariscal.

2023 Trabajos Finales y Tesinas

  1. G.N. Molina, «Estudio de sólidos de Van der Waals mediante teoría del funcional de densidad electrónica» Tesis de Licenciatura en Física, Facultad de Ciencias Exactas, Físico-Químicas y Naturales, Universidad Nacional de Río Cuarto. Dirección: Manuel Otero y Gustavo Morales.
  2. J. Duarte, «Caracterización del Decaimiento Interatómico por Interacción Coulombiana en Pozos Cuánticos Semiconductores» Tesis de Licenciatura en Física, FAMAF-UNC. Dirección: Federico Pont.
  3. C.A. Vallero, «Análisis del desempeño de algoritmos aplicados a la selección de monedas sobre Bitcoin» Tesis de Licenciatura en Ciencias de la Computación, FAMAF-UNC. Dirección: Dr. Luis Ariel Biedma y Dr. Gabriel Eduardo Moyano.
  4. M.C. Bastien y F.G. Tavolaro, «Análisis de complejos proteicos desordenados utilizando dinámica molecular como complemento al RMN: identificación de residuos claves y comportamiento dinámico» Tesis para optar al título de Bioingenieros en el Intituto Biotecnológico de Buenos Aires (ITBA). Dirección: Dra. María Laur Fernández y Dra. Cristina Marino Buslje.
  5. I.A. Polcowñuk Iriarte, «Estudio computacional de catalizadores de tipo SAC conformado por Mo soportado sobre SiO2 para la reacción de formación de NH3 a partir de la hidrogenación de la molécula de nitrógeno.» Tesis de Licenciatura en Química, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de la Plata. Dirección: Reinaldo Pis Diez y Julián Del Plá.
  6. F. Venturi, «Simulaciones de magnetosferas en sistemas binarios compactos: estudio de métricas aproximadas y su implementación numérica.», Tesis de Licenciatura en Física, FAMAF-UNC. Dirección: Federico Carrasco.

2022

Informe de Gestión 2022

2022 Producción científica

  1. N.S. Adler, L.A. Cababie, C. Sarto, C.N. Cavasotto, L.G. Gebhard, D.A. Estrin, …, S.B. Kaufman. «Insights into the product release mechanism of dengue virus NS3 helicase.» Nucleic Acids Research 50.12 (2022): 6968-6979. DOI: 10.1093/nar/gkac473.
  2. S.S. Malunavar, A. Athmanand, P. Prabhala, R.G. Kalkhambkar, G.L. Borosky, K.K. Laali. «N-ethyltetramethylguanidinium ionic liquid [ETMG][EtSO3] as organocatalyst and solvent for facile amide synthesis by formyl-transfer with N-formyl-saccharin.» Tetrahedron Letters 104 (2022): 153990. DOI: 10.1016/j.tetlet.2022.153990.
  3. F.R. Pantano, E.P.M. Leiva, M.I. Rojas. «Changes in electronic structure of graphene by adsorption of low melamine coverages.» Surface Science 723 (2022): 122120. DOI: 10.1016/j.susc.2022.122120.
  4. C. Charalambous, C.A. Giuppone, O.M. Guilera, «Web of resonances and possible path of evolution of the small Uranian satellites.» Astrophysics and Space Science 367, no. 5 (2022):54.
  5. W.D. Castro‐Godoy, L.M. Bouchet, M. Puiatti, L.C. Schmidt, J.E. Argüello, «Purpurin‐Promoted Photo‐Redox Reduction of Benzyl Selenocyanates as Masked Selenols, Preparative, Electrochemical, Computational, and Mechanistic Study.» ChemistrySelect 7.43 (2022): e202204061.
  6. G.L. Borosky, K.K. Laali. «A DFT Computational and Synthetic Study of New Curcuminoidpropargyl Adducts with Pseudo‐Cofacial Aryl Rings.» ChemistrySelect 7.43 (2022): e202203127.
  7. C.M. Clemente, M.I. Freiberger, S. Ravetti, D.M. Beltramo, A.G. Garro, «An in silico analysis of Ibuprofen enantiomers in high concentrations of sodium chloride with SARS-CoV-2 main protease.» Journal of Biomolecular Structure and Dynamics 40.12 (2022): 5653-5664.
  8. R. Casal, L.E. Di Persia, G. Schlotthauer, «Temporal convolutional networks and transformers for classifying the sleep stage in awake or asleep using pulse oximetry signals.» Journal of Computational Science 59 (2022): 101544.
  9. L. Gutiérrez Marcantoni, S. Elaskar, J. Tamagno. «Simulación mediante OpenFOAM de la reflexión de ondas de choque en superficies sólidas curvas.» 2022 IEEE Biennial Congress of Argentina (ARGENCON). IEEE, 2022.
  10. S. Levis, A. Villegas, J. Escrig, N. Bajales Luna, D.M. Arciniegas Jaimes, «Propiedades cuasi-estáticas de nanoestructuras unidimensionales de Permalloy: un análisis comparativo en función de parámetros geométricos.» Anales AFA Vol. 33 Nro. 2, 31-35 (2022).
  11. D.M. Arciniegas Jaimes, M.I. Broens, E. Saavedra, N. Bajales Luna, J. Escrig, «Wave reversal mode in permalloy wire-tube nanostructures.» AIP Advances 12, 035044 (2022).
  12. L. Monaldi, L. Gutiérrez Marcantoni, S. Elaskar. «OpenFOAMTM Simulation of the Shock Wave Reflection in Unsteady Flow.» Symmetry 14.10 (2022): 2048.
  13. J. Almeira, T.S. Grigera, D.R. Chialvo, S.A. Cannas. «Tricritical behavior in a neural model with excitatory and inhibitory units.» Physical Review E, 106(5), 054140 (2022).
  14. A. Sahade, M. Cécere, M.V. Sieyra, G. Krause, H. Cremades, A. Costa. «Pseudostreamer influence on flux rope evolution.» Astronomy and Astrophysics 662 A113 (2022). DOI: 10.1051/0004-6361/202243618
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  16. E.M. Gavilán-Arriazu, D. Barraco, Y. Ein-Eli, E.P.M. Leiva. «Fast charging of alkali-ion batteries at the single-particle level: the impact of particle geometry on diffusional and kinetic bottlenecks in voltammetry.» Journal of Solid State Electrochemistry (2022): 1-9.
  17. A. Gayol, J. Vedelago, M. Valente. «MRI-LINAC dosimetry approach by Monte Carlo codes coupling charged particle radiation transport with strong magnetic fields.» Radiation Physics and Chemistry (2022): 110171.
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  19. M. Valente, F. Mattea, G. Martín, T. Moyano, P. Pérez. «Adaptation of a microCT facility for automatic recognition of bioceramic‐based sealers in molar root canals aimed at endodontic treatment quality control.» X‐Ray Spectrometry 51.3 (2022): 241-250.
  20. N.E. Martín, M. Sofo Haro, M. Valente. «Caracterización de la respuesta del espectrómetro Amptek XR-100-CDTE mediante simulación Monte Carlo con el código Penélope.» Anales (Asociación Física Argentina). Vol. 33. No. 2. 2022.
  21. R. Meilij, E. Aon, M. Valente. «Metodología para definir esquemas de irradiación a partir de archivos de espacios de fase para simular planificación en radioterapia.» Anales (Asociación Física Argentina). Vol. 33. No. 2. Asociación Física Argentina, 2022.
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  24. A. Anchi, S.M. Sutar, R.G. Kalkhambkar, G.L. Borosky, K.K. Laali. «Tropylium‐BF4 as Organocatalyst for Efficient Synthesis of Nitriles from Aldoximes; Synthetic Scope and Mechanistic Insights.» ChemistrySelect 7, no. 35 (2022): e202202791.
  25. E.M. Gavilán-Arriazu, S.A. Rodriguez. «Study of the electrochemical betanidin oxidation path using computational methods.» Physical Chemistry Chemical Physics 24, no. 32 (2022): 19269-19278.
  26. L.M. Farigliano, P.A. Paredes-Olivera, E.M. Patrito. «Ab-initio molecular dynamics simulations of the reactivity of MoS2 towards F2 molecules: Implications for etching processes.» Applied Surface Science (2022): 154637.
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  31. G. De Luca, J. Luque Di Salvo, A. Cipollina, G.L. Luque, A. Fuoco, E.P.M. Leiva, G. Micale, Vertically aligned carbon nanotubes for monovalent cation selective membranes designed by in silico experiments, Desalination. 544 (2022) 116123.
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  55. E.d.V. Gómez, M.A. Burgos Paci, S. Amaya Roncancio, L.B. Avalle, M.C. Gimenez, «Adsorption and Diffusion of O Atoms on Metallic (100) Surfaces. Cluster and Periodic Slab approaches», Computational and Theoretical Chemistry, 1208 (2022) 113556. DOI: https://doi.org/10.1016/j.comptc.2021.113556
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  59. P.S. Cappellari, G.J. Soldano, M.M. Mariscal, «Bimetallic Synergy on Iridium–Gold Catalysts for the CO Oxidation Reaction», The Journal of Physical Chemistry C 2022 126 (4), 1742-1750, DOI: 10.1021/acs.jpcc.1c07719.
  60. J. Torres-Díaz, G.B. Grad, E.V. Bonzi, «Measurement of linear accelerator spectra, reconstructed from percentage depth dose curves by neural networks», Physica Médica 96 (2022) 81-89.
  61. A.L. Di Bartolo, D. Masone, «Synaptotagmin-1 C2B domains cooperatively stabilize the fusion stalk via a master-servant mechanism», Chem. Sci. vol. 13, p. 3437-3446, 2022.
    Software:
    Mezcla del PR#803 en PLUMED.
    Divulgación:
    Entrevista a Diego Masone, programa La Ciencia y la Salud, Radio Red 101 (101.5), Mendoza Capital, 19 marzo 2022.
    «Describen el funcionamiento de una proteína clave para la sinapsis neuronal«, Portal CONICET, 10 marzo 2022.
    » ‘Serafín’ la supercomputadora argentina empleada en la investigación«, Unidiversidad, Sistema de Medios de UNCuyo, 15 marzo 2022.

2022 Vinculación de la UNC usando recursos del CCAD

Asistencia virtual para sacar turnos médicos

Empresa: KUNAN SA.
Equipo FAMAF: K. Palacio, E. Haluszka, F. Racciatti, L. Argüello, D. Robins.

Descripción: desarrollo de Merlín, un producto de datos y asistente conversacional para sacar turnos médicos. Gracias a los recursos brindados desde FAMAF, se han logrado mejoras significativas en los tiempos de entrenamiento de los modelos de machine learning de Merlín y en el procesamiento de bases de datos conversacionales.

2022 Cursos para la Comunidad

  1. Curso de posgrado/grado/extensión: Simulaciones micromagnéticas aplicadas al diseño y estudio de nanoestructuras. 2022. RHCD-2021-433-FAMAF.

2022 Tesis de Doctorado

  1. C.M. Clemente, «Diseño y desarrollo de nuevos fármacos para el tratamiento de enfermedades infecciosas desatendidas.» Tesis Doctoral Cs. Químicas, FCQ-UNC. Dirección: Dr. Daniel A. Allemandi y Dr. Lisandro Y. Hergert.

2022 Trabajos Finales y Tesinas

  1. F. Mélica, «Estudio teórico-experimental de superficies nanoestructuradas con propiedades magnéticas.» Practicanato Profesional de la Licenciatura en Química, FCQ-UNC. Directora: Dra. Diana M. Arciniegas Jaimes.
  2. L. Palacios, «Simulaciones aceleradas de péptidos de alanina.» Practicanato profesional de Licenciatura en Biotecnología. Director: S. Alexis Paz.
  3. J. Momoli, “Modelos computacionales de reacción difusión para la comprensión y mejora de la degradación enzimática de celulosa”. Tesis de Licenciatura en Ciencias Biológicas, FCEN-UBA. Director: Dr. Patricio O. Craig.
  4. C. Salinas Domján, «Comparación entre tratamientos X-knife y protonterapia para metástasis cerebral por simulación Monte Carlo». Tesis de Licenciatura Física FAMAF-UNC. Director: Dr. Mauro Valente y Lic. Diego G. Franco.
  5. R. Gilli, «Caracterización morfológica por micro-tomografía computada de piezas dentales con tratamientos de conducto». Tesis de Licenciatura Física FAMAF-UNC. Director: Dr. Facundo Mattea y Dr. Mauro Valente.

2021

Informe de Gestión 2021

2021 Producción científica

  1. C. Charalambous, C. Beauge, «The 8/5 resonance between TRAPPIST-1 innermost planets». Boletín de la Asociación Argentina de Astronomía, vol. 62, p.41-43, July 2021.
  2. L. Gutiérrez Marcantoni, S. Elaskar, J. Tamagno, J. Saldía, G. Krause. «An assessment of the OpenFOAM implementation of the KNP scheme to simulate strong explosions.» Shock Waves 31.2 (2021): 193-202.
  3. P.E. Antezana, S. Municoy, M.G. Bellino, M.F. Martini, M.F. Desimone. “Nanodelivery of the Gramicidin Peptide for Enhancing Antimicrobial Activity”. European Journal of Lipid Science and Technology, 123(8), 2000389, 2021.
  4. J. Porta, M. Domínguez, F. Tamarit. “Automatic data imputation in time series processing using neural networks for industry and medical datasets”. Communications in Computer and Information Science, International Conference on Information Management and Big Data (SimBig 2021). Springer, 2021.
  5. F.S. Lozano-Negro, P.R. Zangara, H.M. Pastawski, «Ergodicity breaking in an incommensurate system observed by OTOCs and loschmidt echoes: From quantum diffusion to sub-diffusion», Chaos, Solitons & Fractals 150, 2021.
  6. N. Almeira, J.I. Perotti, A. Chacoma, O.V. Billoni, «Explosive dismantling of two-dimensional random lattices under betweenness centrality attacks», Chaos, Solitons & Fractals 153(1), https://doi.org/10.1016/j.chaos.2021.111529, 2021.
  7. A. Sahade, M. Cécere, A. Costa, H. Cremades, «Polarity relevance in flux-rope trajectory deflections triggered by coronal holes», AAP 652(2021), doi:10.1051/0004-6361/202141085.
  8. J.J. Velasco, P. Vélez, M.E. Zoloff Michoff, A. Visintín, D. Versaci, S. Bodoardo, G.L. Luque, E.P.M. Leiva, «Role of the solvent in the activation of Li2S as cathode material: a DFT study», J. Phys.: Condens. Matter 33 344003, 2021.
  9. R. Vroemans, S.R. Ribone, J. Thomas, L. Van Meervelt, T. Ollevier, W. Dehaen, «Synthesis of homochiral sulfanyl- And sulfoxide-substituted naphthyltriazoles and study of the conformational stability», Organic and Biomolecular Chemistry, 2021, doi:10.1039/d1ob00784j.
  10. C. Balbuena, M.M. Gianetti, E.R. Soulé, «A structural study and its relation to dynamic heterogeneity in a polymer glass former», Soft Matter, 2021 vol. 17.
  11. C. Balbuena, M. Gianetti, E.R. Soulé, «Molecular dynamic simulations of the formation of Ag nanoparticles assisted by PVP» Physical Chemistry Chemical Physics, 2021 vol. 23.
  12. V. Miguel, M.E. Sánchez-Borzone, M.E. Mariani, D.A. García, «Modulation of membrane physical properties by natural insecticidal ketones», Biophysical Chemistry, Volume 269, 2021.
  13. A. Loiacono, M.J. Gomez, F.R. Negreiros, J.A. Olmos-Asar, M. M. Mariscal, G.I. Lacconi, E.A. Franceschini, «MoS2 Effect on Nickel Electrochemical Activation: An Atomistic/Experimental Approach», J Phys Chem C 125, 18640 – DOI: 10.1021/acs.jpcc.1c03067, 2021.
  14. M. Mariappan Sivalingam, J.A. Olmos-Asar, E. Vinoth, T. Tharmar, M. Shkir, Z. Said, K. Balasubramanian, «Copper Oxide Nanorod/Reduced Graphene Oxide Composites for NH3 Sensing», ACS Applied Nano Materials 4, 12977 – DOI: 10.1021/acsanm.1c01831, 2021.
  15. J.C. Jiménez-García, J.A. Olmos-Asar, E.A. Franceschini, M.M. Mariscal, «Effect of Nafion content and hydration level on the electrochemical area of a Pt nanocatalyst in the triple-phase boundary», Phys. Chem. Chem. Phys. 23, 27543 – DOI: 10.1039/D1CP03731E, 2021.
  16. V. Scardino, M. Bollini, C.N. Cavasotto, «Combination of pose and rank consensus in docking-based virtual screening: the best of both worlds», RSC Advances 11, 35383-35391, 2021.
  17. J.A. de la Rosa Abad, A. Londoño-Calderon, E.M. Bringa, G.J. Soldano, S.A. Paz, U. Santiago, S.J. Mejía-Rosales, M.J. Yacamán, M.M. Mariscal, «Soft or Hard? Investigating the Deformation Mechanisms of Au-Pd and Pd Nanocubes under Compression: An Experimental and Molecular Dynamics Study», J. Phys. Chem. C 2021, 125, 45, 25298–25306, November 4, 2021, 10.1021/acs.jpcc.1c07685.
  18. I.J. Chevallier-Boutell, G.A. Monti, H. Corti, J.A. Olmos-Asar, M.B. Franzoni, R.H. Acosta, «Non-negligible interactions of alkanes with silica mesopores affect self-diffusivity: Insights from first-principles calculations», Microporous and Mesoporous Materials, Volume 326, October 2021, 111315, DOI: 10.1016/j.micromeso.2021.111315.
  19. E.M. Gavilán-Arriazu, M.P. Mercer, D.E. Barraco, H.E. Hoster, E.P.M Leiva, «Voltammetric behaviour of LMO at the nanoscale: a map of reversibility and diffusional limitations», ChemPhysChem, 2021. DOI: 10.1002/cphc.202100700.
  20. E.M. Gavilán-Arriazu, D.E. Barraco, E.P.M Leiva, «On how interactions influence kinetic limitations in alkali-ion batteries. Application to Li-ion intercalation into graphite through voltammetric experiments», Journal of Solid State Electrochemistry, 2021, 25, 2793–2806. DOI: 10.1007/s10008-021-05079-6.
  21. C.M. Correa, D.J. Paz, A.G. Sánchez, A.N. Ruiz, N.D. Padilla, R.E. Angulo, «Redshift-space effects in voids and their impact on cosmological tests Part I: the void size function», Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Volume 500, Issue 1, pp.911-925, January 2021.
  22. W. Yang, C.J. Ruestes, Z. Li, O.T. Abad, T.G. Langdon, B. Heiland, M. Koch, E. Arzt, M.A. Meyers, «Micro-mechanical response of ultrafine grain and nanocrystalline tantalum», Journal of Materials Research and Technology, 12, pp.1804-1815, 2021.
  23. D. Insuasty, S. García, R. Abonia, B. Insuasty, J. Quiroga, M. Nogueras, J. Cobo, G.L. Borosky, K.K. Laali, «Design, synthesis, and molecular docking study of novel quinoline-based bis-chalcones as potential antitumor agents», Archiv der Pharmazie 2021, 354, e2100094.
  24. F.M. Alexander, S. Fonrouge, J.L. Borioni, M. Del Pópolo, P.N. Horton, B. Hutchings, D.E. Crawford, S.L. James, «Noria and its derivatives as hosts for chemically and thermally robust Type II porous liquids», Chem. Sci., 2021,12, 14230-14240.
  25. P. López, M. Cautun, D. Paz, M. Merchán, R. van de Weygaert, «Deviations from tidal torque theory: Evolution of the halo spin-filament alignment», Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Volume 502, Issue 4, pp.5528-5545, April 2021.
  26. J. Sánchez, M. Molina, «Trading of information modalities for zero-shot classification», Proc. Winter Conf. on Applications of Computer Vision WACV 2022.
  27. F. Fernandez, S.A. Paz, M. Otero, D. Barraco and E.P.M. Leiva, «Characterization of amorphous LixSi structures from ReaxFF via accelerated exploration of local minima», Physical Chemistry Chemical Physics 23 (31), 16776-16784 DOI: DOI https://doi.org/10.1039/D1CP02216D, July 2021.
  28. M. Mazuecos, F.M. Luque, J. Sánchez, H. Maina, T. Vadora, L. Benotti, «Region under Discussion for visual dialog», Proceedings of the 2021 Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing.
  29. M. Mazuecos, P. Blackburn, L. Benotti, «The Impact of Answers in Referential Visual Dialog», Proceedings of the Reasoning and Interaction Conference (ReInAct 2021).
  30. L. Battini, D.M. Fidalgo, D.E. Álvarez, M. Bollini, «Discovery of a Potent and Selective Chikungunya Virus Envelope Protein Inhibitor through Computer-Aided Drug Design», ACS Infectious Diseases, 2021.
  31. A. Ruderman, S. Smrekar, M.V. Bracamonte, E.N. Primo, G.L. Luque, J. Thomas, E. Leiva, G.A. Monti, D.E. Barraco, F. Vaca Chávez, «Unveiling the stability of Sn/Si/graphite composites for Li-ion storage by physical, electrochemical and computational tools», Physical Chemistry Chemical Physics 23(5) DOI: 10.1039/D0CP05501H, January 2021.
  32. D.C. Pinilla Peña, E. N. Ruiz Pereyra, G. Firpo, N. Ceballos, F. Fülöp, Z. Szakonyi, A.G. Iriarte, W.J. Peláez, «Flash Vacuum Pyrolysis (FVP) of cis-N-phenyl-hexahydro-2H- benzo[d][1,3]oxazin-2-imine and thiazin-2-imine derivatives», EuroJOC, 10.1002/ejoc.202001613, jan 2021.
  33. E. del V. Gómez, S. Amaya-Roncancio, L.B. Avalle, M.C. Gimenez, «DFT Study of adsorption and diffusion of H2O and related species on Cu(100) surfaces», Surface Science, Volume 714, December 2021, 121920.
  34. M. Caparotta, D. Masone, «Cholesterol plays a decisive role in tetraspanin assemblies during bilayer deformations», Biosystems, Volume 209, 104505, 2021.
  35. M. Caparotta, M. Puiatti, D. Masone, «Artificial stabilization of the fusion pore by intra-organelle styrene-maleic acid copolymers», Soft Matter, 2021, vol. 17 p.8314-8321.
  36. R. De Propris; M.J. West, F. Andrade-Santos, C. Ragone-Figueroa, E. Rasia, W. Forman, C. Jones, R. Kipper, S. Borgani, D.G. Lambas, E. Romashkova, K.C. Patra, «Brightest cluster galaxies: the centre can(not?) hold», Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Volume 500, Issue 1, 2021.
  37. A.L. Reviglio, F.A. Martínez, M.D.A. Montero, Y. Garro-Linck, G.A. Aucar, N.R. Sperandeo, G.A. Monti, «Accurate location of hydrogen atoms in hydrogen bonds of tizoxanide from the combination of experimental and theoretical models», RSC Adv., 2021,11, 7644-7652.
  38. S.S. Saini, M.F. Martini, «A green hybrid microextraction for sensitive determination of bisphenol A in aqueous samples using three different sorbents: Analytical and computational studies», 2021. Microchemical Journal 160, 105612.
  39. D.M. Arciniegas Jaimes, S. Raviolo, J.M. Carballo, N. Bajales, J. Escrig, «Wave reversion mode stability as a function of diameter and wall thickness for permalloy and nickel nanotubes», Journal of Magnetism and Magnetic Materials 523, 2021, 167578.
  40. T. Gallardo, C. Beaugé, C.A. Giuppone. «Semianalytical model for planetary resonances-Application to planets around single and binary stars.» Astronomy & Astrophysics 646 (2021): A148.
  41. C.N. Cavasotto, J.I. Di Filippo, «In silico Drug Repurposing for COVID-19: Targeting SARS-CoV-2 Proteins through Docking and Consensus Ranking», Mol Inform. 40(1):e2000115, 2021.
  42. C.M. Clemente, M.I. Freiberger, S. Ravetti, D.M. Beltramo, A.G. Garro, «An in silico analysis of Ibuprofen enantiomers in high concentrations of sodium chloride with SARS-CoV-2 main protease», Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, DOI: 10.1080/07391102.2021.1872420, 2021.
    Divulgación: Demuestran la eficacia del ibuprofeno inhalable contra la propagación del coronavirus, TELAM.
  43. R. Casal, L.E. Di Persia, G. Schlotthauer, «Classifying sleep–wake stages through recurrent neural networks using pulse oximetry signals», Biomedical Signal Processing and Control, Volume 63, January 2021.
  44. R. R. Casal, L.E. Di Persia, G. Schlotthauer. «Automatic sleep staging from pulse oximeter using RNN.» In 2021 29th European Signal Processing Conference (EUSIPCO), pp. 965-969. IEEE, 2021.
  45. M. Valente, D. Chacón, F. Mattea, R. Meilij, P. Pérez, M. Romero, I. Scarinci, J. Vedelago, F. Vitullo, A. Wolfel. «Linear energy transfer characterization of five gel dosimeter formulations for electron and proton therapeutic beams.» Applied Radiation and Isotopes 178 (2021): 109972.
  46. L.M. Farigliano, P.A. Paredes-Olivera, E.M. Patrito. «Oxidative etching of S-vacancy defective MoS 2 monolayer upon reaction with O 2.» Physical Chemistry Chemical Physics 23, no. 17 (2021): 10225-10235.
  47. J.P. Cerutti, V. Aiassa, M.A. Fernández, M.R. Longhi, M.A. Quevedo, A. Zoppi. «Structural, physicochemical and biological characterization of chloramphenicol multicomponent complexes.» Journal of Molecular Liquids 331 (2021): 115761.
  48. E.D. Farias, M.E. Zoloff Michoff, V. Sueldo Occello, V. Brunetti, M.C.G. Passeggi, T. Glatzel. «KPFM and DFT as tools to correlate the charge distribution and molecular orientation of dendritic adsorbates on different surfaces.» Applied Surface Science 565 (2021): 150552.
  49. D.K. Jacquelín, F.A. Soria, P.A. Paredes-Olivera, E.M. Patrito. «Reactive Force Field-Based Molecular Dynamics Simulations on the Thermal Stability of Trimesic Acid on Graphene: Implications for the Design of Supramolecular Networks.» ACS Applied Nano Materials 4, no. 9 (2021): 9241-9253.
  50. I. Marini, S. Borgani, A. Saro, G.L. Granato, C. Ragone-Figueroa, B. Sartoris, K. Dolag, G. Murante, A. Ragagnin, Y. Wang. «Velocity dispersion of brightest cluster galaxies in cosmological simulations.» Monthly Notices of the Royal Astronomical Society 507, no. 4 (2021): 5780-5795.

2021 Vinculación del CCAD

Proyecto ARPH.AI, CIECTI

Provisión de infraestructura de cómputo, almacenamiento, seguridad y respaldo por un año para el desarrollo del Proyecto ARPH.AI ejecutado por el CIECTI.

FAdeA S.A.

Convenio específico para la provisión de horas de cómputo para CFD según RR 1376/2020.

2021 Cursos para la Comunidad

  1. Primer Tutorial Latinoamericano de Magnetismo sobre OOMMF y MUMAX, 11 y 12 de Noviembre 2021. Responsables orientadores: Prof. Juan Escrig- Prof. Noelia Bajales Luna.
  2. Curso de posgrado/grado/extensión: Micromagnetismo aplicado a estructuras de baja dimensionalidad. 1er cuatrimestre de 2021, carga anexa. Acta-771/2021-UNC-DEC#FAMAF.
  3. Fernando Gleiser, «Instrumentación Dinámica en el Kernel de Linux utilizando eBPF«, curso de 2 encuentros de 2 horas dictado el 19 de mayo y 9 de junio.
    Videos: clase 1, clase 2.

2021 Tesis de Doctorado

  1. C.M. Correa, «Vacíos cósmicos como laboratorios cosmológicos», Tesis Doctorado en Astronomía, OAC-UNC, Director: Dr. Dante Javier Paz (OAC-UNC), 2021.
  2. J. Torres Díaz, «Redes neuronales artificiales y método Monte Carlo aplicado a la radioterapia», Tesis de Doctorado en Ingeniería, Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales UNC, Director: E. Bonzi (FaMAF-UNC).
  3. E. del V. Gómez, «Estudios Computacionales y Experimentales de Reacciones Superficiales Relacionadas con Celdas de Combustible», Tesis de Doctorado en Cs. Químcas, UNC, mayo 2021, Directoras: Dra. María Cecilia Giménez y Dra. Lucía Avalle.

2021 Tesis de Maestría

  1. A.A. Baricalla, «Genómica, transcriptómica y proteómica de neuropéptidos de Oncopeltus fasciatus (Hemiptera: Lygaeidae)», Tesis de Maestría en Bioinformática y biología de sistemas, UNNOBA-UNQ, Junio de 2021. Dirección del Dr. Rolando Rivera-Pomar.
  2. G.A. Robiglio Torresi, «Análisis exhaustivo del sistema de combustible de una aeronave bimotor.» Tesis de Maestría en Ciencias de la Ingeniería con Mención
    Aeroespacial, FAMAF-UNC y Facultad de Ingeniería-UIA. Dirección: Dr. Carlos Sacco y Co-dirección: Ing. Carlos Espinedo.

2021 Trabajos Finales y Tesinas

  1. V. Tapia Mattar, «Estudio mecanístico del comportamiento electroquímico de antioxidantes empleando simulaciones computacionales”, Tesina de la Lic. en Química de la FAyA-UNSE. Resolución F.A.A. N° 071/2021, Director Dr. Sergio A. Rodriguez.
  2. S. Ledesma-Bazán, «Estudio de cambios transcriptómicos de ARN largos no codificantes (lncRNAs) durante la progresión del cáncer de próstata», Tesis de Lic. en Biotecnología, FBQF-UNT, Laboratorio de Inflamación y Cáncer, Departamento de Química Biológica, Director: Dr. Javier Cotignola, 27/5/2021.
  3. E. Gianuzzi, «Estudio de la evolución de diferentes nubes protoestelares en simulaciones»,Trabajo Especial de la Lic. en Astronomía, 2021, FaMAF-UNC. Dirección: Federico Stasyszyn.
  4. A. Rodríguez, «Análisis de re-simulaciones de regiones subdensas de la estructura en gran escala del universo», Trabajo Especial de la Lic. en Astronomía, 2021, FaMAF-UNC, Dirección: Dante Paz, Codirección: Federico Stasyszyn.
  5. A.H. Urquiza Toledo, «Zero-shot Object Detection», Trabajo Especial de la Licenciatura en Ciencias de la Computación, 2021, FaMAF-UNC, Dirección: Jorge A. Sánchez.
  6. M. Schmidt, «Explotando características contextuales para la detección de posturas en Twitter en el marco de la vacunación del COVID-19 en Argentina», Trabajo Especial de la Licenciatura en Ciencias de la Computación, 2021, FaMAF-UNC, Directora: Laura Alonso Alemany.

2020

Informe de Gestión 2020

2020 Producción científica

  1. R.E. Domínguez, A. Anzani, M. Berasategui, L. Lanfri, M.A. Burgos Paci, W.J. Peláez, G.A. Argüello, A.G. Iriarte, «Elucidation of the photodegradation mechanism of CCl3C(O)NH2, CClF2C(O)NH2 and CF3C(O)NH2 in solid state (266 nm) and solution (254 nm). Experimental and theoretical studies», J. Photoch. Photobiol. A. 393 (2020)112415.
  2. J.A. Vila, A.G. Iiarte, M.S. Chiappero, F.E. Malanca, «Thermal Decomposition of CF C ( O ) OONO ( x = 2 , 3 , 4 )», J. Phys. Chem. A. 124(2020)6363.
  3. N. Almeira, O.V. Billoni, and J.I. Perotti, «Scaling of percolation transitions on Erdös-Rényi networks under centrality-based attacks», Phys. Rev. E 10, 012306 (2020).
  4. L. Bassini, E. Rasia, S. Borgani, G.L. Granato, C. Ragone-Figueroa, V. Biffi, A. Ragagnin, K. Dolag, W. Lin, G. Murante, N.R. Napolitano, G. Taffoni, L. Tornatore, Y. Wang, «The DIANOGA simulations of galaxy clusters: characterising star formation in protoclusters», Astronomy & Astrophysics, Volume 642, 2020.
  5. L. Pereyra, M.A. Sgró, M. Merchán, F. Stasyszyn, D. Paz, «Detection and analysis of cluster-cluster filaments», MNRAS.499.4876P, 2020.
  6. A. Rost, F. Stasyszyn, L. Pereyra, H.J. Martínez, «A comparison of cosmological filaments catalogues», MNRAS.493.1936R, 2020.
  7. M. Montesinos, J. Garrido-Deutelmoser, J. Olofsson, C.A. Giuppone, J. Cuadra, A. Bayo, M. Sucerquia, N. Cuello, «Dust trapping around Lagrangian points in protoplanetary disks», Astronomy and Astrophysics 2020, 642, A224.
  8. N.D. Aagaard, J.C. Azcárate, J.A. Olmos-Asar, M.M. Mariscal, J. Solla-Gullón, E. Zelaya, M.H. Fonticelli, «Mechanistic Framework for the Formation of Different Sulfur Species by Electron Irradiation of n-Dodecanethiol Self-Assembled Monolayers on Au(111) and Au(100)», J. Phys. Chem. C 2020, 124, 41, 22591–22600.
  9. J.C. Jiménez-García, J.A. Olmos-Asar, E.E. Franceschini, M.M. Mariscal, «Electrochemical area of graphene-supported metal nanoparticles from an atomistic approach», Journal of Applied Electrochemistry, 2020 50, 421–429.
  10. I. Felsztyna, M.E. Sánchez-Borzone, V. Miguel, D.A. García, «The insecticide fipronil affects the physical properties of model membranes: A combined experimental and molecular dynamics simulations study in Langmuir monolayers», Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Biomembranes, Volume 1862, Issue 10, 2020.
  11. G.L. Borosky, K.K. Laali, «Recent advances in the development of ‘curcumin inspired’ compounds as new therapeutic agents» (Mini-Review), Mini-Reviews in Medicinal Chemistry 2020, 20, 1543-1558.
  12. K.K. Laali, A.T. Zwarycz, N. Beck, G.L. Borosky, M. Nukaya, G.D. Kennedy, «Curcumin conjugates of non-steroidal anti-inflammatory drugs: synthesis, structures, anti-proliferative assays, computational docking, and inflammatory response», ChemistryOpen 2020, 9, 822-834.
  13. S.M. Sutar, H.M. Savanur, R.G. Kalkhambkar, G.L. Borosky, G. Aridoss, K.K. Laali, «Ionic liquid catalyzed Ritter reaction/Pd-catalyzed directed ortho-arylation; facile access to diverse libraries of biaryl-amides from aryl-nitriles», Tetrahedron Letters 2020, 61, 152553.
  14. G.L. Borosky, «Alkaline phosphatases: in silico study on the catalytic effect of conserved active site residues using human placental alkaline phosphatase (PLAP) as a model protein», Journal of Chemical Information and Modeling 2020, 60, 6228.6241.
  15. L.M. Farigliano, M.A. Villarreal, E.P.M. Leiva, S.A. Paz, «Thermodynamics of Nanoparticle Coalescence at Different Temperatures via Well-Tempered Metadynamics», Journal of Physical Chemistry C, 10.1021/acs.jpcc.0c07619, 2020.
  16. M. Caparotta, C.N. Tomes, L.S. Mayorga, D. Masone, «The Synaptotagmin-1 C2B Domain Is a Key Regulator in the Stabilization of the Fusion Pore», Journal Of Chemical Theory And Computation (JCTC), https://doi.org/10.1021/acs.jctc.0c00734, 2020.
  17. J. Torres Díaz, G.B. Grad, C.D. Venencia, E.V. Bonzi, «A novel and fast methodology to calculate doses in LDR brachytherapy», Applied Radiation and Isotopes 166 (2020) 109394.
  18. M. Mazuecos, A. Testoni, R. Bernardi, L. Benotti, «On the role of effective and referring questions in GuessWhat?!», Proceedings of the First Workshop on Advances in Language and Vision Research, 2020.
  19. S. Raviolo, D. M. Arciniegas Jaimes, N. Bajales, J. Escrig, «Wave reversal mode: a new magnetization reversal mechanism in magnetic nanotubes», Journal of Magnetism and Magnetic Materials 497, 2020.
  20. S. Raviolo, A. Pereira, D. M. Arciniegas Jaimes, J. Escrig, N. Bajales, «Angular dependence of the magnetic properties of Permalloy nanowire array: A comparative analysis between experiment and simulation», Journal of Magnetism and Magnetic Materials 499, 2020.
  21. M. Sosa-Pivatto, G.A. Camps, M.C. Baranzelli, A. Espíndola, A.N. Sérsic, A. Cosacov, «Connection, isolation and reconnection: Quaternary climatic oscillations and the Andes shaped the phylogeographical patterns of the Patagonian bee Centris cineraria (Apidae)», Biological Journal of the Linnean Society, 2020.
  22. M.P. Ronco, M.R. Schreiber, C.A. Giuppone, D. Veras, J. Cuadra, O.M. Guilera, «How Jupiters Save or Destroy Inner Neptunes around Evolved Stars», The Astrophysical Journal Letters, Volume 898, Number 1, 2020.
    Divulgación: UNCiencia, Comunicación OAC, Página 12.
  23. M.I. Rojas, O. Andreussi, C.G. Gomez, L.B. Avalle, «Kinetics and Mechanism of the Hydrogen Peroxide Reduction Reaction on a Graphite Carbon Nitride Sensor», The Journal of Physical Chemistry C 124 (1) 336-346. https://doi.org/10.1021/acs.jpcc.9b07315
  24. S.A. Rodríguez, M.T. Baumgartner, «Betanidin pKa Prediction Using DFT Methods», ACS OMEGA 2020. http://doi.org/10.1021/acsomega.0c00904.
  25. J.I. Perotti, N. Almeira, F. Saracco, «Towards a generalization of information theory for hierarchical partitions», Phys.Rev.E 101, 062148, junio 2020.
  26. F.A. Soria, E.M. Patrito, «How to Avoid the Oxidation of Silicene/Ag(111)? Reaction Mechanisms of O2 with Chlorinated Silicene», J.Phys.Chem. C 2020, 124, 13, 7327–7333.
  27. E.M. Gavilán-Arriazu, J.M. Hümöller, O.A. Pinto, B.A. López de Mishima, E.P.M. Leiva, O.A. Oviedo, «Fractional and integer stages of lithium ion-graphite systems. The role of electrostatic and elastic contributions», Phys. Chem. Chem. Phys. Accepted, (2020). doi:10.1039/D0CP01886D
  28. E.M. Gavilán-Arriazu, M.P. Mercer, O.A. Pinto, O.A. Oviedo, D.E. Barraco, H.E. Hoster, E.P.M. Leiva, «Numerical simulations of cyclic voltammetry for lithium-ion intercalation in nanosized systems: finiteness of diffusion versus electrode kinetics», J. Solid State Electrochem. (2020). doi:10.1007/s10008-020-04717-9
  29. E.M. Gavilán-Arriazu, M.P. Mercer, O.A. Pinto, O.A. Oviedo, D.E. Barraco, H.E. Hoster, E.P.M. Leiva, «Effect of Temperature on The Kinetics of Electrochemical Insertion of Li-Ions into a Graphite Electrode Studied by Kinetic Monte Carlo», J. Electrochem. Soc. 167 (2020) 13533. doi:10.1149/2.0332001JES
  30. S. Smrekar, M.E. Zoloff Michoff, J.E. Thomas, C.A. Calderón, L.M. Farigliano, A. Visintin, E.P.M. Leiva, D.E. Barraco «On the effect of the carbonaceous substrate in the nucleation of Sn nanoparticles for Li-ion anodes: experiments and first principles calculations», Journal of Solid State Electrochemistry, 2018, 22, 1721–1733.
  31. A. Sahade, M. Cécere, G. Krause, «Influence of Coronal Holes on CME Deflections: Numerical Study», The American Astronomical Society, junio 2020.
    Divulgación: IATE-OAC, Periferia Ciencia.
  32. C.N. Cavasotto, J.I. Di Filippo, «In silico Drug Repurposing for COVID-19: Targeting SARS-CoV-2 Proteins through Docking and Quantum Mechanical Scoring», ChemRxiv, https://doi.org/10.26434/chemrxiv.12110199, 2020.
  33. C.N. Cavasotto, M.G. Aucar, «High-throughput docking using quantum mechanical scoring», Molecular Front Chem., 8:246, 2020.
  34. C.N. Cavasotto, «Binding Free Energy Calculation using Quantum Mechanics Aimed for Drug Lead Optimization», Methods Mol. Biol., 2114:257-268, 2020.
  35. M.G. Aucar, C.N. Cavasotto, «Molecular Docking Using Quantum Mechanical Methods», Methods Mol.Biol., 2114:269-284, 2020.
  36. M. Caparotta, D. Bustos, D. Masone, «Order-disorder skewness in alpha-synuclein: a key mechanism to recognize membrane curvature», Phys. Chem. Chem. Phys. 2020. vol. 22, (9), pp 5255-5263. The Royal Society of Chemistry. doi 10.1039/C9CP04951G.
  37. A.V. Dan Córdoba, V. Aiassa, M.R. Longhi, M.A. Quevedo, A. Zoppi. «Improved activity of rifampicin against biofilms of Staphylococcus aureus by multicomponent complexation.» AAPS PharmSciTech 21, no. 5 (2020): 1-13.
  38. M.S. Faillace, A.P. Silva, A.L. Alves Borges Leal, L. Muratori da Costa, H.M. Barreto, W.J. Peláez. «Sulfated and Oxygenated Imidazoline Derivatives: Synthesis, Antioxidant Activity and Light‐Mediated Antibacterial Activity.» ChemMedChem 15, no. 10 (2020): 851-861.
  39. M.D.P. Martínez, R.C. Buceta. «Energetic analysis of disorder effects in an artificial spin ice with dipolar interactions.» Journal of Physics: Condensed Matter 32, no. 28 (2020): 285801.

2020 Vinculación con Industria/Estado usando recursos del CCAD

Caracterización estructural y determinación de la resistencia a la tensión de hebras de plata

Empresa: PROMEDON.
Prestatario: CCT Córdoba CONICET, a través del Dr. Fábio Negreiros Ribeiro y la Dra. Jimena Olmos Asar.

Descripción: Se realizaron simulaciones computacionales atomísticas a nivel semi-empírico para determinar la variación de la energía de alambres de plata trenzados sometidos a una tensión unidireccional. Se consideraron alambres de distintas longitudes y diámetros, y con diferentes grados de trenzado. Determinaremos así el grado de trenzado que optimiza la respuesta del alambre a la tensión, en función de sus dimensiones.
Las prótesis peneanas fabricadas y comercializadas por la empresa PROMEDON poseen un núcleo compuesto esencialmente por alambres de plata trenzados. Como la prótesis es comúnmente sometida a ciclos de tensión durante su tiempo de vida, el objetivo del proyecto es realizar una caracterización, utilizando simulaciones computacionales a nivel atomístico, de dichos alambres de plata, destacando los efectos del tamaño de los mismos y del grado de trenzado.

Framework para la Evaluación de Calidad de Imágenes

Empresa: Satellogic.

Descripción: desarrollo de un framework para la evaluacion de calidad de imágenes según su utilidad para extraer información de ellas mediante redes neuronales. Este proyecto obtuvo un subsidio de investigación en el Ministerio de Ciencia y Tecnología de España. En este contexto, para algunos experimentos se usó Nabucodonosor, principalmente como backup de los servers de la división de Data Science and Solutions de Satellogic sede Barcelona.

2020 Vinculación de la UNC usando recursos del CCAD

Logística del Transporte de Caudales

Empresa: Naranja.
Equipo FAMAF: D. Fernández, N. Jares, L. Biedma, P. Pury.

Descripción: Modelado matemático optimizado e implementación en máquina del sistema de logística del retiro de caudales en las más de 180 sucursales de la empresa distribuidas en todo el país.

Detección inteligente de eventos críticos en series temporales

Empresa: QPlus S.A.
Equipo FAMAF: M. Domínguez, F. Tamarit.

Descripción: se implementó un sistema de análisis inteligente de series temporales, a partir de lo cuales se pueda predecir con antecedencia el surgimiento de eventos críticos para el funcionamiento de equipos de producción.

2020 Vinculación del CCAD

CIAP-INTA, UFyMA-CONICET

Se puso en funcionamiento un cluster del UFYMA compuesto por una cabecera HP DL580 Gen9 con 2*Xeon E7-4809v3+512GB RAM+5*SSD 256GB y dos nodos HP ProLiant XL170r Gen9 con 2*Xeon E5-2620v4+128GB RAM.

Los equipos estaba sin instalar ni usar hace varios años. Se instaló CentOS 7 y OpenHPC con SLURM en la cabecera y se configuraron los nodos para booteo remoto. También se instaló R y varios paquetes con optimizaciones para ejecutar desde el sistema de colas.

Una gran parte del trabajo consistió en instalar además la plataforma web Galaxy e integrarla con el sistema de colas. Desde esta plataforma los distintos usuarios cuentan con variadas herramientas de bioinformática disponibles en la plataforma y mediante la interfaz web pueden enviar los trabajos al cluster y manipular los resultados.

2020 Cursos para la Comunidad

  1. Noelia Bajales Luna, Dra. Diana Marcela Arciniegas Jaimes, «Curso de Introducción al Micromagetismo: de OOMMF a Mendieta«, en el marco de curso de extensión. FaMAF-UNC, Córdoba. Período: Octubre 2019-Marzo 2020 y Período COVID 19: Junio-Diciembre 2020.

2020 Tesis de Doctorado

  1. M. Molina, «Fenómenos intrínsecos en clasificación de imágenes sin ejemplos», Tesis de Doctorado en Ciencias de la Computación, FaMAF-UNC, Director: Jorge A. Sánchez, 2020.
  2. M. Zarepour, «Criticalidad en modelos de actividad neuronal: efectos del tamaño y topología de la red», Tesis de Doctorado en Neurociencias, UNC, octubre de 2020, Director: S. A. Cannas (FaMAF-UNC).
  3. L.A. Pereyra, «Identificación de filamentos cosmológicos», Tesis Doctoral en Astronomía, 2020, FaMAF-UNC, Director: Dr. Manuel Enrique Merchán (FaMAF-UNC).
  4. C. Charalambous, «Análisis dinámico de sistemas resonantes multi-planetarios», Tesis Doctoral en Astronomía, 2020, FaMAF-UNC. Director: Cristián Beaugé.

2020 Trabajos Finales y Tesinas

  1. A. Rodríguez, «Análisis de re-simulaciones de regiones subdensas de la estructura en gran escala del universo», Trabajo Especial de la Lic. en Astronomía, 2020, FaMAF-UNC. Dirección: Dante Paz, Federico Stasyszyn.
  2. J.O. Seia, «Estudio comparativo de algoritmos de reducción de dimensionalidad a ser usados en spike sorting». Proyecto Integrador de la carrera de Ingeniería Biomédica de la FCEFyN. Asesores: Ana Carolina Maldonado, Jorge Adrián Sánchez, Emilio Kropff.
  3. I. Gómez, «Modelado computacional de los cátodos de baterías de Li-S basados en el compósito SPAN», Trabajo Final del Practicanato de la Licenciatura en Química, FCQ-UNC, 2019. Dirección de Dr. Martin E. Zoloff Michoff.

2019

Informe de Gestión 2019

2019 Producción científica

  1. L. Bassini, E. Rasia, S. Borgani, C. Ragone-Figueroa, V. Biffi, K. Dolag, M. Gasparini, G.L. Granato, , G. Murante, G. Taffoni, L. Tornatore, «Black hole mass of central galaxies and cluster mass correlation in cosmological hydro-dynamical simulations», Astronomy & Astrophysics, Volume 630, 2019.
  2. C.A. Giuppone, N. Cuello, «Parametric study of polar congurations around binaries», Journal of Physics: Conference Series 1365, 2019.
  3. E.S. Leal, N.S. Adler, G.A. Fernández, L.G. Gebhard, L. Battini, M.G. Aucar, M. Videla, M.E. Monge, A. Hernández de los Ríos, J.A. Acosta Dávila, M.L. Morell, S.M. Cordo, C.C. García, A.V. Gamarnik, C.N. Cavasotto, M. Bollini, «De novo design approaches targeting an envelope protein pocket to identify small molecules against dengue virus», Eur.J.Med.Chem, 182:111628, 2019.
  4. J. Frau, M. Teruel, L. Alonso Alemany, S. Villata. «Different Flavors of Attention Networks for Argument Mining». Proceedings de la conferencia FLAIRS-32, Florida, Estados Unidos, 2019.
  5. M. Teruel, L. Alonso Alemany. «Early Dropout Prediction with Neural Co-embeddings». Proceedings de la conferencia FLAIRS-32, Florida, Estados Unidos, 2019.
  6. L. Andrini, G.J. Soldano, M.M. Mariscal, F.G. Requejo, Y. Joly, «Structure stability of free copper nanoclusters: FSA-DFT Cu-building and FDM-XANES study», Journal of Electron Spectroscopy and Related Phenomena 235, (2019)1-7.
  7. S.R. Martinez, C.C. Pavani, M.S. Baptista , M.C. Becerra, M.A. Quevedo, S.R. Ribone, «Identification of the potential biological target of N-benzenesulfonyl-1,2,3,4-tetrahidroquinoline compounds active against gram-positive and gram-negative bacteria», J. Biomolec. Struc. and Dynam. doi.org/10.1080/07391102.2019.1633410.
  8. F.R. Negreiros, Th. Obermüller, M. Blatnik, M. Mohammadi, A. Fortunelli, F.P. Netzer, S. Surnev, «Ultrathin WO3 Bilayer on Ag(100): A Model for the Structure of 2D WO3 Nanosheets», J. Phys. Chem. C 123, 27584-27593 (2019) – 10.1021/acs.jpcc.9b07990.
  9. F.R. Negreiros, G.J. Soldano, S. Fuentes, T. Zepeda, M.J. Yacamánc, M.M. Mariscal, «The unexpected effect of vacancies and wrinkling on the electronic properties of MoS2 layers», Physical Chemistry Chemical Physics 21, 24731-24739 (2019) – 10.1039/C9CP04347K.
  10. J.A. Olmos-Asar, M.M. Mariscal, «Avoiding oxidation with coating: graphene protected magnesium surfaces», Physical Chemistry Chemical Physics 21 (34), 18660-18666, 2019.
  11. E.M. Gavilán-Arriazua, O.A. Pinto, B.A. López de Mishima, D.E. Barraco, O.A. Oviedo, E.P.M. Leiva, «Kinetic Monte Carlo applied to the electrochemical study of the Li-ion graphite system», Electrochimica Acta, available online 6 December 2019, 135439.
  12. P. López, M.E. Merchán, D.J. Paz, «Deviations from tidal torque theory: environment dependences on halo angular momentum growth», Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Volume 485, Issue 4, p.5244-5255, June 2019.
  13. V. Miguel, M.A. Villarreal, D.A. García, «Effects of gabergic phenols on the dynamic and structure of lipid bilayers: A molecular dynamic simulation approach», PLoS ONE 14(6): e0218042. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0218042, June 2019.
  14. P. Céspedes, E. Rufeil-Fiori, P.A. Bouvrie, A.P. Majtey, C. Cormick, «Description of composite bosons in discrete models», Phys. Rev. A 2019, 100, 012309.
  15. M. Zarepour, J.I. Perotti. O.V. Billoni, D.R. Chialvo, S.A. Cannas, «Universal and non universal neural dynamics on small world connectomes: a finite size scaling analysis», Physical review E 100, 052138 (2019),
    e-print arXiv:1905.05280, doi: 10.1103/PhysRevE.100.052138.
  16. M. Sucerquia, J. Alvarado-Montes, J. Zuluaga, N. Cuello, C.A. Giuppone, «Ploonets: formation, evolution, and detectability of tidally detached exomoons», Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, 489 2313S, 2019.
    Divulgación: Comunicación OAC, Clarín, Canal U, Canal 12.
  17. N. Cuello, C.A. Giuppone, «Stability and dynamics of misaligned circumbinary discs», 2019, A&A, https://doi.org/10.1051/0004-6361/201833976
  18. M.C. Ruete, V.E.P. Zarelli, D. Masone, M. de Paola, D.M. Bustos, C.N. Tomes, «A connection between reversible tyrosine phosphorylation and SNARE complex disassembly activity of N-ethylmaleimide-sensitive factor unveiled by the phosphomimetic mutant N-ethylmaleimide-sensitive factor-Y83E», Mol Hum Reprod. 2019.
  19. R. Abonia, L.F. Gutiérrez, B. Insuasty, J. Quiroga, K.K. Laali, C. Zhao, G.L. Borosky, S.M. Horwitz, S.D. Bunge, «Catalyst-free assembly of giant tris(heteroaryl)methanes: synthesis of novel pharmacophoric triads and model sterically crowded tris(heteroaryl/aryl)methyl cation salts», Beilstein Journal of Organic Chemistry 2019, 15, 642-654.
  20. G.L. Borosky, K.K. Laali, M. Mascal, «Phospha- and arsa-bridged cyclononatetraenides: novel zwitterionic 10π aromatic hemispheres», New Journal of Chemistry 2019, 43, 6267-6273.
  21. K.K. Laali, A.T. Zwarycz, S.D. Bunge, G.L. Borosky, M. Nukaya, G.D. Kennedy, «Deuterated curcuminoids: synthesis, structures, computational/docking and comparative cell viability assay against colorectal cancer», ChemMedChem 2019, 14, 1173-1184.
  22. E.R. González, G.B. Grad, E.V. Bonzi, «Influence of the sample density in γ spectrometry», Applied Radiation and Isotopes 152 (2019) 86–90.
  23. C.M. Correa, D.J. Paz, N.D. Padilla, A.N. Ruiz, R.E. Angulo, A.G. Sánchez, «Non-fiducial cosmological test from geometrical and dynamical distortions around voids», Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Volume 485, Issue 4, June 2019, Pages 5761–5772.
  24. V.H. Purrello, J.L. Iguain, A.B. Kolton, «Roughening of the anharmonic Larkin model», Physical Review E 99, 032105 (2019)
  25. M.F. Quevedo, M.A. Bustos, D. Masone, C.M. Roggero, D.M. Bustos, C.N. Tomes, «Grab recruitment by Rab27A-Rabphilin3a triggers Rab3A activation in human sperm exocytosi», Biochimica et Biophysica Acta-Molecular Cell Research, 2019 vol. 1866 p. 612 – 622.
  26. L.F. Gutiérrez Marcantoni, J. Tamagno, S. Elaskar, «A numerical study on the impact of chemical modeling on simulating methane-air detonations», Fuel Volume 240, 15 March 2019, Pages 289-298.
  27. D. Masone, D.M. Bustos, «Transmembrane domain dimerization induces cholesterol rafts in curved lipid bilayers», Physical Chemistry Chemical Physics (PCCP). DOI: 10.1039/C8CP06783J. Advance Article 2019.
  28. M.D. Santi, C. Bouzidi, N.S. Gorod, M. Puiatti, S. Michel, R. Grougnet, M.G. Ortega, «In vitro biological evaluation and molecular docking studies of natural and semisynthetic flavones from Gardenia oudiepe (Rubiaceae) as tyrosinase inhibitors», Bioorganic Chemistry 2019, 82, 241-245.
  29. G. Firpo, M.V. Cooke, W.J. Peláez, G.M. Chans, G.A. Argüello, E. Gómez, C. Alvarez‐Toledano. «Rearomatization of trifluoromethyl sulfonyl dihydropyridines: Thermolysis vs photolysis.» Journal of Physical Organic Chemistry 32, no. 1 (2019): e3789.
  30. O.A. Douglas-Gallardo, M. Berdakin, T. Frauenheim, C.G. Sánchez. «Plasmon-induced hot-carrier generation differences in gold and silver nanoclusters.» Nanoscale 11, no. 17 (2019): 8604-8615.
  31. M.J. Ferronato, D.J. Obiol, E.N. Alonso, J.A. Guevara, S.M. Grioli, M. Mascaró, M.L. Rivadulla et al. «Synthesis of a novel analog of calcitriol and its biological evaluation as antitumor agent.» The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology 185 (2019): 118-136.
  32. M.D. Santi, M.A. Peralta, M. Puiatti, J.L. Cabrera, M.G. Ortega. «Melanogenic inhibitory effects of Triangularin in B16F0 melanoma cells, in vitro and molecular docking studies.» Bioorganic & Medicinal Chemistry 27, no. 16 (2019): 3722-3728.
  33. M. Berdakin, O.A. Douglas-Gallardo, C.G. Sanchez. «Interplay between Intra-and Interband Transitions Associated with the Plasmon-Induced Hot Carrier Generation Process in Silver and Gold Nanoclusters.» The Journal of Physical Chemistry C 124, no. 2 (2019): 1631-1639.
  34. J.P. Cerutti, M.A. Quevedo, N. Buhlman, M.R. Longhi, A. Zoppi. «Synthesis and characterization of supramolecular systems containing nifedipine, β-cyclodextrin and aspartic acid.» Carbohydrate polymers 205 (2019): 480-487.
  35. N. Arisnabarreta, P. Paredes-Olivera, F.P. Cometto, E.M. Patrito. «Growth of Layered Copper–Alkanethiolate Frameworks from Thin Anodic Copper Oxide Films.» The Journal of Physical Chemistry C 123, no. 28 (2019): 17283-17295.
  36. N. Cuello, C.A. Giuppone. «Planet formation and stability in polar circumbinary discs.» Astronomy & Astrophysics 628 (2019): A119.
  37. C. Balbuena, M.M. Gianetti, E.R. Soulé. «Static and dynamic correlation lengths in supercooled polymers.» The Journal of Chemical Physics 150, no. 23 (2019): 234508.

2019 Vinculación de la UNC usando recursos del CCAD

Desarrollo de un estimador de adhesión al débito automático.

Equipo Rentas Córdoba: M.L. García, M. de los Ángeles Mignon, G. Coseani, M. Geremía, E. Romano.
Equipo FAMAF: F. Tamarit, D. Barsotti, M. Domínguez, J.C. Rodríguez.

Descripción: a partir de datos sobre contribuyentes adheridos al débito automático de Rentas Córdoba, se entrenó un modelo de aprendizaje automático,
Este modelo se aplicó a los contribuyentes no-adheridos a fin detectar y ofrecer la posibilidad a este conjunto de la población.

Divulgación: FaMAF, Córdoba Primero, InfoNegocios, Canal 10.

Desarrollo de Estimador de Costos mediante Monte Carlo

Empresa: OSDE.
Equipo FAMAF: A. Gonzalez Montoro, P. Pury.

Descripción: Se procesaron millones de registros de consumos médicos a nivel nacional de los últimos tres años para generar distribuciones de frecuencia y severidad de los consumos en grupos diseñados de socios para poder estimar costos de diferentes productos.

2019 Vinculación del CCAD

Maestría en Estadística Aplicada – UNC

Capacitación y trabajo interdisciplinario sobre el uso de R en CCAD para estudiantes, docentes y egresados de la Maestría en Estadística de la UNC.

IDEA-CONICET

Instalación de un servidor de cálculo para el IDEA Instituto de Diversidad y Ecología Animal. «Power Workstation DELL» con 2*Xeon E5-2620 v3 y 64 GiB de RAM. Instalación del Stack OpenHPC, sistema de colas SLURM. Instalación de lenguaje R optimizado y diverso software para GIS. Instalación y configuración de R Studio Server para acceso web remoto a la IDE.

NaranjaImage result for naranja logo

Mejora en la confiabilidad de un código de interfaz para autorizaciones de cobro. Se limpió y mejoró un código de misión crítica que tenía fallas esporádicas. Las fallas desaparecieron, el código se encuentra en producción.

2019 Cursos para la Comunidad

  1. Carlos Bederián, Nicolás Wolovick, «Minicurso HPC@CAB», Centro Atómico Bariloche, CNEA, 5 al 7 de agosto, 12hs.
    Mañana 1: Arquitectura de CPU, Wolovick.
    Tarde 1: Low Hanging Fruit en HPC, Bederián.
    Mañana 2: Arquitectura de GPU, Wolovick.
    Tarde 2: Práctico 1, [código], Bederián.
    Mañana 3: Herramientas para análisis de desempeño, Bederián.
  2. Marcos Mazzini, Juan Cruz Rodríguez, «R en el CCAD«, Curso de la Maestría en Estadística Aplicada, 20 y 21 de marzo, 24 y 25 de abril,  8hs. Clase 1, Clase 2, Clase 3, Clase 4.

2019 Tesis de Doctorado

  1. F.M. Zanotto, «Procesos electroquímicos acoplados: aproximación teórico-experimental», Tesis Doctoral en Ciencias Químicas, 2019, FCQ, UNC. Director: Dr. Sergio A. Dassie.
  2. M.A. Via, «Interacción de Poliargininas con Membranas Lipídicas», Tesis Doctoral en Ciencias Químicas, 2019, FCQ-UNC/FCEN-UNCUYO, Doctorado cooperativo. Directores: Dr. Mario G. Del Pópolo (FCEN-UNCUYO) y Dra. Natalia Wilke (FCQ-UNC).

2019 Trabajos Finales y Tesinas

  1. F. Nievas, “Automatización de Cefalometrías utilizando métodos de aprendizaje automático”, Trabajo Especial de la Licenciatura en Ciencias de la Computación,  FaMAF, UNC, agosto 2019. Dirección del Dr. Jorge Sánchez.
  2. N.A. Balderramas Morgan, «Estudio Computacional de propiedades Mecanoquímicas de Nanoalambres de ZnO en medio acuoso», Trabajo Final del Practicanato de la Licenciatura en Química, FCQ-UNC, 2019. Dirección de Dr. Germán J. Soldano.

2018

Informe de Gestión 2018

2018 Producción científica

  1. P.G. Celayes, M.A. Domínguez. «Prediction of user retweets based on social neighborhood information and topic modelling.» Mexican International Conference on Artificial Intelligence. Springer, Cham, 2018.
  2. M. Teruel, C. Cardellino, F. Cardellino, L. Alonso Alemany, S. Villata. «Legal text processing within the MIREL project». Proceedings de Workshop on Language Resources and Technologies for the Legal Knowledge Graph, parte de la conferencia LREC, en Miyazaki, Japón, 2018.
  3. M. Teruel, C. Cardellino, F. Cardellino, L. Alonso Alemany, S. Villata. «Increasing Argument Annotation Reproducibility by Using Inter-annotator Agreement to Improve Guidelines». Proceedings de la 11th International Conference on Language Resources and Evaluation (LREC), Miyazaki, Japón, 2018.
  4. F.A. Soria, W. Zhang, P.A. Paredes-Olivera, A.C.T. van Duin, E.M. Patrito, «Si/C/H ReaxFF Reactive Potential for Silicon Surfaces Grafted with Organic Molecules», J. Phys. Chem. C, 2018, 122 (41), pp 23515–23527.
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  40. L.L. Patera, F. Bianchini, C. Africh, C. Dri, G. Soldano, M.M. Mariscal, M. Peressi, G. Comelli, «Real-time imaging of adatom-promoted graphene growth on nickel», Science, Vol. 359, Issue 6381, pp. 1243-1246, DOI: 10.1126/science.aan8782, 2018.
    Divulgación: FCQ, La Voz del Interior, UNCiencia, CONICET.
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  49. M.J. Ferronato, E.N. Alonso, M.E. Fermento, N.A. Gandini, M.A. Quevedo, J. Arévalo, A. López Romero, E. Mascaró, C. Vitale, A.C. Curino, M.M. Facchinetti, «Antitumoral effects of the alkynylphosphonate analogue of calcitriol EM1 on glioblastoma multiforme cells», The Journal of steroid biochemistry and molecular biology 178 (2018): 22-35.

2018 Vinculación de la UNC usando recursos del CCAD

Procesamiento inteligente de imágenes odontológicas

Empresa: MedicalUp S.A.
Equipo FAMAF: F. Tamarit, J. Sánchez, J. Porta, F. Nieva.

Descripción: Se implementó mediante el uso de redes neuronales profundas, un sistema de aprendizaje automático capaz de identificar puntos especiales, de valor clínico, en imágenes cefalométricas. Este desarrollo dio lugar a dos tesinas de grado, la del Lic. Juan Porta y la del Lic. Francisco Nievas.

2018 Vinculación del CCAD

NaranjaImage result for naranja logo

Mejora en tiempos del proceso de cierre por lotes para la generación de resúmenes en PDF. Se logró una aceleración de 4x, mejorando la eficiencia paralela del 40% al 80%.
Nota en TSS donde se reseña el trabajo: «Vínculo Inteligente«.
Artículo «Un Caso de Transferencia de Tecnología de HPC entre CCAD-UNC, FAMAC-UNC y Tarjeta Naranja» presentado en la JUI de la 48JAIIO.

Universidad Católica de Córdoba

Instalación del software de un cluster de cómputo científico. Se instaló una cabecera Xeon E5-2609v2 y 4 nodos Xeon E5-2620v3 siguiendo la guía OpenHPC con Warewulf y SLURM sobre CentOS.





2018 Cursos para la Comunidad

  1. Marcos Mazzini, «De 0 a CCAD en 90 minutos«, «Bash: uso cotidiano y trucos«, 3 de octubre de 2018.
  2. Marcos Mazzini, «Introducción a BASH 1«, «Introducción a BASH 2«, 26 de abril y 3 de mayo de 2018.

2018 Tesis de Doctorado

  1. M. Otero, «Desarrollo de nuevo materiales nanoestructurados con aplicación en baterías de ion-litio», Tesis Doctoral en Física, 2018, FaMAF, UNC. Directores: Dr. Ezequiel Leiva y Dr. Jorge Trincavelli.

2018 Trabajos Finales y Tesinas

  1. L.M. Vargas Calderón, «Aceleración de un modelo numérico de predicción del tiempo para aplicaciones en alerta temprana a emergencias», Trabajo Especial de la Licenciatura en Ciencias de la Computación, FaMAF, UNC, diciembre 2018. Dirección del Msc. Andrés Lighezzolo (CONAE) y del Dr. Nicolás Wolovick (CCAD, UNC).

2017

Informe de Gestión 2017

2017 Producción cientifica

  1. F.A. Soria, W.Zhang, A.C.T. van Duin, E.M. Patrito, «Thermal Stability of Organic Monolayers Grafted to Si(111): Insights from ReaxFF Reactive Molecular Dynamics Simulation», ACS Appl. Mater. Interfaces, 2017, 9 (36), pp 30969–30981.
  2. X.S. Ramos, C. Charalambous, P. Benítez-Llambay, C. Beaugé, «Planetary migration and the origin of the 2:1 and 3:2 (near)-resonant population of close-in exoplanets», Astronomy & Astrophysics, Volume 602, id.A101, 11 pp. June 2017.
  3. D.A. Caminos, J.I. Bardagí, M. Puiatti, A.B. Peñéñory, «Anions involved in initiation of the thermal induced SRN1 reaction for α-arylation of ketones», RSC Advances 2017, 7, 31148-31157.
  4. M.E. Budén, J.I. Bardagí, M. Puiatti, R.A. Rossi, «Initiation in Photoredox C-H Functionalization Reactions. Is Dimsyl Anion a Key Ingredient?», J. Org. Chem. 2017, 82, 8325-8333. Featured article. Seleccionado para tapa Issue 16. Agosto.
  5. J.L. Borioni, M. Puiatti, D. Mariano, A. Vera, A.B. Pierini, «In search of the best DFT functional for dealing with organic anionic species», Phys. Chem. Chem. Phys. 2017, 19, 9189-9198.
  6. C. Charalambous, X.S. Ramos, P. Benítez-Llambay, C. Beaugé, «Orbital migration and Resonance Offset of the Kepler-25 and K2-24 systems», JPhCS 911(1), article id. 012027 (2017).
  7. F.A. Stasyszyn, «The magnetic universe through vector potential SPMHD simulations», Boletín de la Asociación Argentina de Astronomía, vol. 59, p. 103-105, 2017.
  8. C.J. Ruestes, I.A. Alhafez, H.M. Urbassek, «Atomistic Studies of Nanoindentation-A Review of Recent Advances», Crystals, 7(10), 293, 2017.
  9. E.N. Millán, C.J. Ruestes, N. Wolovick, E.M. Bringa, «Boosting Materials Science Simulations by High Performance Computing», ENIEF 2017.
  10. F.L. Carrasco, O.A. Reula, «Novel scheme for simulating the force-free equations: Boundary conditions and the evolution of solutions towards stationarity», Phys. Rev. D 96, 063006 (2017).
  11. J. Klug, D. Masone, M.G. Del Pópolo, «Molecular-level insight into the binding of arginine to a zwitterionic Langmuir monolayer», RSC Advances, (2017), 7, 30862-30869.
  12. J. Grossi, J.J. Kohanoff, N.J. English, E.M. Bringa, M.G. Del Pópolo, «On the Mechanism of the Iodide-Triiodide Exchange Reaction in a Solid-State Ionic Liquid», J. Phys. Chem. B, 2017, 121, 6436-6441.
  13. V.V. Galassi, M.G. Del Pópolo, T.M. Fischer, N. Wilke, «A Molecular Explanation for the Abnormal Flux of Material Into a Hot Spot in Ester Monolayers», J. Phys. Chem. B, 2017, 121, 5621-5632.
  14. G.L. Borosky, «Quantum mechanical study on the catalytic mechanism of alkaline phosphatases», Journal of Chemical Information and Modeling 2017, 57, 540-549.
  15. G.L. Borosky, K.K. Laali, «A computational study of SF5-substituted carbocations», Journal of Fluorine Chemistry 2017, 197, 118-133.
  16. L.F. Gutiérrez Marcantoni, J. Tamagno, S. Elaskar, «rhoCentralRfFoam: An OpenFOAM solver for high speed chemically active flows – Simulation of planar detonations –», Computer Physics Communications, Volume 219, 2017, Pages 209-222.
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  18. L.M. Farigliano, S.A. Paz, E.P.M. Leiva, M.A. Villarreal, «Coalescence of Nanoclusters Analyzed by Well-Tempered Metadynamics. Comparison with Straightforward Molecular Dynamics», J. Chem. Theory Comput., 2017, 13 (8), pp 3874–3880.
  19. J.M. Montes de Oca, C.A. Menéndez, S.R. Accordino, D.C. Malaspina, G.A. Appignanesi, «Studies on electrostatic interactions within model nano-confined aqueous environments of different chemical nature», European Physical Journal E 40, 78 (2017).
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  28. O.A. Douglas-Gallardo, G.J. Soldano, M.M. Mariscal, C.G. Sánchez, «Effects of oxidation on the plasmonic properties of aluminum nanoclusters», Nanoscale, The Royal Society of Chemistry; 2017;19:409–10.
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  34. C.E. Budde, P.R. D’Argenio, R.E. Monti, «Compositional Construction of Importance Functions in Fully Automated Importance Splitting», 10th International Conference on Performance Evaluation Methodologies and Tools, ValueTools 2016, Taormina, Italy, to appear.
  35. G.N. Rimondino, D.P. Henao, W.J. Peláez, G.A. Argüello, F.E. Malanca. «Photo-oxidation of dimethyl malonate initiated by chlorine atoms in gas phase: kinetics and mechanism.» The Journal of Physical Chemistry A 121, no. 45 (2017): 8577-8582.

2017 Vinculación del CCAD

M.A. Competición SRL

Elaboración de especificaciones técnicas, instalación, puesta a punto y mantenimiento de un servidor de cálculo para CFD. La empresa M.A. Competición, hubicada en el complejo Pro Racing de Villa Carlos Paz, es una de las preparadoras del equipo Renault Sport en la categoría más importante de automovilismo de pista de la Argentina, el Super TC2000. El equipo de cálculo es un dual Xeon E5-2680v4 con 256 GiB de RAM DDR4 2400 MHz y 4 TiB de capacidad de almacenamiento. Sobre este equipo se instaló un CentOS con SLURM como manejador de colas. El equipo es utilizado 24/7 para la producción de modificaciones aerodinámicas en el chasis del auto.

2017 Tesis de Doctorado

  1. X.S. Ramos, «Arquitectura y Evolución de Sistemas Planetarios en Resonancias de dos Cuerpos», Tesis Doctoral en Astronomía, FaMAF, UNC, 2017. Dirección del Dr. Cristián Beaugé.
  2. C.E. Budde, «Automation of Importance Splitting Techniques for Rare Event Simulation», Tesis Doctoral Cs. de la Computación, FaMAF, UNC, mayo 2017. Dirección del Dr. Pedro R. D’Argenio.
  3. L.R. Ceballos, «Aeroelasticidad No-Lineal de Vehículos Aéreos No-Tripulados con una Configuración No-Convencional de Alas Unidas «. Tesis Doctoral Cs. de la Ingeniería, FCEFyN, UNC. abril 2017. Dirección del Dr. Sergio Preidikman.

2017 Trabajos Finales y Tesinas

  1. S. Raviolo, «Sistemas híbridos de baja dimensionalidad obtenidos a partir de plataformas mesoporosas», Trabajo Especial de Licenciatura en Física, FAMaF-UNC, 2017. Dirección de Dra. Noelia Bajales Luna
  2. R.D. Graña, «Comparación de arquitectura AMD e Intel para ejecución de Gadget». Trabajo Especial de la Licenciatura en Ciencias de la Computación, FaMAF, UNC, 2017. Dirección del Dr. Federico Stasyszyn y del Dr. Nicolás Wolovick.

2016

Informe de Gestión 2016

2016 Producción cientifica

  1. L.M. Alarcón, M.A. Frías, M.A. Morini, M.B. Sierra, G.A. Appignanesi and E.A. Disalvo, «Water populations in restricted environments of lipid membrane interphases», European Physical Journal E 39, 94 (2016).
  2. C.A. Menéndez, S.R. Accordino, D.C. Gerbino, G.A. Appignanesi, «Hydrogen bond dynamic propensity studies for protein binding and drug design», PLoS ONE 11, e0165767 (2016).
  3. J.M. Montes de Oca, J.A. Rodriguez Fris, S.R. Accordino, D.C. Malaspina, G.A. Appignanesi, «Structure and dynamics of high- and low-density water molecules in the liquid and supercooled regimes», European Physical Journal E 39, 124 (2016).
  4. M.J. Ferronato, E.N. Alonso, N.A. Gandini, M.E. Fermento, M.E. Villegas, M.A. Quevedo, J. Arévalo, A. López Romero, M.L. Rivadulla, G. Gómez, Y. Fall, M.M. Facchinetti, A.C. Curino, «The UVB1 Vitamin D analogue inhibits colorectal carcinoma progression», The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology, (2016), 163, 193-205.
  5. S. García Méndez, F.J. Otero Espinar, A. Luzardo Alvarez, M.R. Longhi, M.A. Quevedo, A. Zoppi, «Ternary complexation of benzoic acid with β-cyclodextrin and aminoacids. Experimental and theoretical studies», Journal of Inclusion Phenomena and Macrocyclic Chemistry, (2016), 85(1), 33-48.
  6. L.M. Soria-Castro, S.A. Elaskar, L.A. Godoy. «Presiones Debidas a Viento en Tanques de Petróleo Alineados en Tandem Mediante CFD». Mecanica Computacional, 34(12), 775-794, AMCA, 2016.
  7. D.K. Jacquelín, M.A. Pérez, E.M. Euti, N. Arisnabarreta, F.P. Cometto, P. Paredes-Olivera, E.M. Patrito. A pH-Sensitive Supramolecular Switch Based on Mixed Carboxylic Acid Terminated Self-Assembled Monolayers on Au(111). Langmuir, 2016, 32, 947–953. DOI: 10.1021/acs.langmuir.5b03807
  8. E.M. Euti, P. Vélez-Romero, E.P.M. Leiva, V.A. Macagno, P.A. Paredes-Olivera, E.M. Patrito, F.P. Cometto. The Role of Tris(2-carboxyethyl)phosphine Reducing Agent in the Controlled Formation of α,ω-Alkanedithiols Monolayers on Au(111) with Monocoordinated and Bicoordinated Configurations. Langmuir, 2016, 32, 9428–9436 DOI: 10.1021/acs.langmuir.6b02079
  9. F.P. Cometto, G. Ruano, C.A. Calderón, O.E. Linarez-Pérez, F. Soria, P.A. Paredes-Olivera, H. Ascolani, G. Zampieri, E.M. Patrito. Thermal and Chemical Stability of n-Hexadecanethiol Monolayers on Au (111) in O2 environments. Electrochim. Acta 2016, 215, 313–325. DOI: 10.1016/j.electacta.2016.08.119
  10. A.M. Reyes, D.S. Vazquez, A. Zeida, M. Hugo, M.D. Piñeyro, M.I. De Armas, D. Estrin, R. Radi, J. Santos, M. Trujillo. PRXQ B from Mycobacterium tuberculosis is a monomeric, thioredoxin dependent and highly efficient fatty acid hydroperoxide reductase. Free Radical Medicine and Biology, 101, 249-260 (2016).
  11. F.M. Issoglio, N. Campolo, A. Zeida, T. Grune, R. Radi, D.A. Estrin, S. Bartesaghi. Exploring the catalytic mechanism of human glutamine synthetase by computer simulation. Biochemistry, 55, 5907-5916 (2016).
  12. F. Samieee, F.N. Pedron, D.A. Estrin, L. Trevani. Experimental and theoretical study of the high temperatura UV-visible spectra of aqueous hydroquinone and 1,4-benzoquinone. J. Phys. Chem. B 120, 10547-10552 (2016).
  13. F.M. Boubeta, S.E. Bari, D.A. Estrin, L. Boechi. Access and binding of H2S to heme proteins: the case of HbI of Lucina Pectinata. Journal of Physical Chemistry B, 120, 9642-9653 (2016).
  14. M. Bringas, J. Semelak, A. Zeida, D.A. Estrin. Theoretical investigation of the mechanism of nitroxyl decomposition in aqueous solution. Journal of Inorganic Biochemistry, 162, 102-108 (2016).
  15. M. Caterino, A. Petruk, A. Vergara, G. Ferraro, D. Marasco, F. Doctorovich, D.A. Estrin, A. Merlino. Mapping the protein-binding sites for Iridium(III) based CO releasing molecules. Dalton Transactions, 45, 12206-12214 (2016).
  16. C.L. Ramirez, A. Petruk, M. Bringas, D.A. Estrin, A.E. Roitberg, M.A. Marti, L. Capece. Coarse-grained simulations of heme proteins: validation and study of large conformational transitions. Journal of chemical theory and computation, 12, 3390-3397 (2016).
  17. V. Demicheli, D.M. Moreno, G.E. Jara, A. Lima, S. Carballal, N. Rios, C.I.Bathyany, G. Ferrer-Sueta, C. Quijano, D.A. Estrin, M.A. Marti, R.Radi. Mechanism of the Reaction of human Mn-Superoxide Dismutase with Peroxynitrite: Nitration of Critical Tyrosine-34. Biochemistry, 55, 3403-3417 (2016).
  18. J.P. Bustamante, M.E. Szretter, M. Sued, M.A. Martí, D.A. Estrin, L. Boechi. A quantitative model for oxygen uptake and release in a family of heme proteins. Bioinformatics, btw083 (2016).
  19. L. Alvarez, A. Lewis Ballester, A.E. Roitberg, D.A. Estrin, S.R. Yeh, M.A. Marti, L. Capece. Structural study of a flexible active site loop in human indoleamine 2,3-dioxygenase and its functional implications. Biochemistry, 55, 2785-2793 (2016).
  20. J.M. Romero, M. Trujillo, D.A. Estrin, G.A. Rabinovich, S. Di Lella. Impact of human galectin-1 binding to saccharide ligands on dimer dissociation kinetics and structure. Glycobiology, (2016).
  21. J. Rinaldi, M. Arrar, G. Sycz, M.L. Cerutti, P.M. Berguer, G. Paris, D.A. Estrin, M.A. Marti, S. Klinke, F.A. Goldbaum, J. Mol. Structural insights into the HWE histidine kinase family: the Brucella Blue light.activated histidine kinase domain. Biology, 428, 1165-1179 (2016).
  22. K.K. Laali, A. Jamalian, G.L. Borosky, Piperidine-appended imidazolium ionic liquids as task-specific catalysts: computational study, synthesis, and multinuclear NMR», Journal of Physical Organic Chemistry 2016, 29, 346-351.
  23. G.L. Borosky, Mutagenicity of heteroaromatic amines: computational study on the influence of methyl substituents, Journal of Molecular Graphics and Modelling 2016, 69, 92-102.
  24. K.K. Laali, B.M. Rathman, S.D. Bunge, Xin Q., G.L. Borosky, Fluoro-curcuminoids and curcuminoid-BF2 adducts: synthesis, x-ray structures, bioassay, and computational/docking study, Journal of Fluorine Chemistry 2016, 191, 29-41.
  25. O.A. Douglas-Gallardo, M. Berdakin, and C.G. Sánchez, «Atomistic Insights into Chemical Interface Damping of Surface Plasmon Excitations in Silver Nanoclusters», The Journal of Physical Chemistry C, 120(42):24389–24399, October 2016.
  26. M. Berdakin, M. Taccone, K.J. Julian, G. Pino, and C.G. Sánchez, «Disentangling the Photophysics of DNA-Stabilized Silver Nanocluster Emitters», The Journal of Physical Chemistry C, 120(42):24409–24416, October 2016.
  27. V. Miguel, M.A. Perillo, M.A. Villarreal, Improved prediction of bilayer and monolayer properties using a refined BMW-MARTINI force field, Biochim Biophys Acta. 2016 Nov;1858(11):2903-2910. doi: 10.1016/j.bbamem.2016.08.016.
  28. E.E. Ambroggio, B. Caruso, M.A. Villarreal, V. Raussens, G.D. Fidelio, Reversing the peptide sequence impacts on molecular surface behaviour, Colloids Surf B Biointerfaces. 2016 Mar 1;139:25-32. doi: 10.1016/j.colsurfb.2015.12.008.
  29. O.V. Billoni, F. Pomiro, S.A. Cannas, C. Martin, A. Maignan, R.E. Carbonio, Magnetization reversal in mixed ferrite-chromite perovskites with non magnetic cation on the A-site, J. Phys.: Condens. Matter 28 476003, 2016.
  30. P. Benítez-Llambay, X.S. Ramos, C. Beaugé, F.S. Masset, Long-scale hydrodynamical simulations of migrating planets, ApJ, Volume 826, Issue 1, article id. 13, pp.
  31. F. Reckziegel, E. Bustos, L. Mingari, W. Báez, G. Villarosa, A. Folch, E. Collini, J. Viramonte, J. Romero,  S. Osores, Forecasting volcanic ash dispersal and coeval resuspension during the April–May 2015 Calbuco eruption. Journal of Volcanology and Geothermal Research, 321, 44-57. (2016)
  32. P.R. Zangara, D. Bendersky, P.R. Levstein, H.M. Pastawski, “Loschmidt echo in many-spin systems: contrasting time-scales of local and global measurements”, Phil. Trans. R. Soc. A. 374, 20150163 (2016).
  33. A. Bruma, U. Santiago, D. Alducin, G. Plascencia-Villa, R.L. Whetten, A. Ponce, M.M. Mariscal, M.J. Yacaman, Structure Determination of Superatom Metallic Clusters using Rapid Scanning Electron Diffraction. J. Chem. Phys. C (2016)120, 1902-1908.
  34. C. Mansilla Wettstein, F.P. Bonafé, M.B. Oviedo, C.G. Sánchez, Optical Properties of Graphene Nanoflakes: Shape Matters, The Journal of Chemical Physics, 144 (2016) 1.
  35. C.R. Medrano, M.B. Oviedo, C.G. Sánchez, Photoinduced Charge-Transfer Dynamics Simulations in Noncovalently Bonded Molecular Aggregates, Phys. Chem. Chem. Phys., 18 (2016) 14840.
  36. G. Lener, P. Velez, E.P.M. Leiva, E.L. Moyano, R.E. Carbonio, «Chemical adsorption of phenacyl-1,2,3-benzotriazole over AMoO4 (0 1 0) scheelite surfaces. Structure and electronic properties». Computational and Theoretical Chemistry. 1090, 120-128, 2016.
  37. K.K. Laali, A. Jamalian, G.L. Borosky, Piperidine-appended imidazolium ionic liquids as task-specific catalysts: computational study, synthesis, and multinuclear NMR, Journal of Physical Organic Chemistry 2016, 29, 346-351.
  38. P. Tripathi, E. Mitsari, M. Romanini, P. Serra, J. Tamarit, M. Zuriaga y  R. Macovez, «Orientational relaxations in solid (1,1,2,2)tetrachloroethane», Journal of Chemical Physics 144, 164505 (2016).
  39. E.M. Perassi, E.P.M. Leiva, «A theoretical model to determine intercalation entropy and enthalpy: Application to lithium/graphite», Electrochemistry Communications 65 (2016): 48-52.
  40. V. Miguel, M. Defonsi Lestard, M.E. Tuttolomondo, S. Díaz, A. Ben Altabef, M. Puiatti, A.B. Pierini, «Molecular View of the Interaction of S-Methyl Methanethiosulfonate with DPPC Bilayer», Biochim. Biophys. Acta-Biomembranes 1858, 38-46, 2016.
  41. P. Benítez-Llambay, F.S. Masset, «FARGO3D: A New GPU-oriented MHD Code» ApJS, 223, 11, 2016.
  42. G.J. Soldano, F.M. Zanotto, M.M. Mariscal, «Mechanochemical stability of sub-nm ZnO chains»,Physical Chemistry Chemical Physics 18, no. 11 (2016): 7688-7694.
  43. J.P. Bustamante, L. Radusky, L. Boechi, D.A. Estrin, A. ten Have, M.A. Martí, «Evolutionary and Functional Relationships in the Truncated Hemoglobin Family», (2016) PLoS Computational Biology, 12 (1), art. no. e1004701, 26 p.
  44. A. Pesce, J.P. Bustamante, A. Bidon-Chanal, L. Boechi, D.A. Estrin, F.J. Luque, A. Sebilo, M. Guertin, M. Bolognesi, P. Ascenzi, M. Nardini, «The N-terminal pre-A region of Mycobacterium tuberculosis 2/2HbN promotes NO-dioxygenase activity», (2016) FEBS Journal, 283 (2), pp. 305-322.
  45. S.R. Ribone, E.M. Schenfeld, M. Madrid, A.B. Pierini, M.A. Quevedo. «Evaluation and synthesis of AZT prodrugs with optimized chemical stabilities: Experimental and theoretical analyses», New Journal of chemsitry,  40 (3), 2383-2392, 2016.
  46. J. Thomas, L. Dobrzańska, L. VanMeervelt, M.A. Quevedo, K. Woźniak, M. Stachowicz, M. Smet, W. Maes, W. Dehaen. «Homodiselenacalix[4]arenes: Molecules with Unique Channelled Crystal Structures». Chemistry – A European Journal, 22 (3), 979-987, 2016.
  47. S.G. Méndez, F.J. Otero Espinar, A. Luzardo, M.R. Longhi, M.A. Quevedo, A. Zoppi. “Ternary complexation of benzoic acid with b-cyclodextrin and aminoacids. Experimental and theoretical studies”. Journal of Inclusion Phenomena and Macrocyclic Chemistry 85, no. 1 (2016): 33-48.
  48. J.G. Martí, P.M. Cincotta, C. Beaugé, “Chaotic Diffusion in the Gliese-876 Planetary System”, Monthly Notices of the Royal Astronomical Society 460, no. 1 (2016): 1094-1105.
  49. N. Caballero, M. Zuriaga, M. Carignano and P. Serra, «Dynamic Heterogeneity In The Monoclinic Phase Of CCl4», Journal of Physical Chemistry B 120, 860, 2016.
  50. D. Henao, W. Peláez, G.A. Argüello, F.E. Malanca. «Photooxidation of Di-tert-butyl Malonate in the Presence and Absence of Nitrogen Dioxide.» The Journal of Physical Chemistry A 120, no. 42 (2016): 8267-8272.
  51. E.N. Millán, S.B. Goirán, M.F. Piccoli, C. García Garino, J.N. Aranibar, E.M. Bringa. «Monte Carlo simulations of settlement dynamics in GPUs.» Cluster Computing 19, no. 1 (2016): 557-566.

2016 Tesis de Doctorado

  1. D. Bendersky, «Decoherencia y Transiciones de Fase en la Dinámica Cuántica en Sistemas de Espines», Tesis Doctoral en Física, FaMAF, UNC, 2016. Dirección del Dr. Horacio Pastawsky.
  2. A. Spitale, «Generación de nanopartículas bimetálicas: aleaciones, núcleo@coraza y de fases segregadas. Un estudio teórico-experimental». Tesis Doctoral Cs. Químicas, FCQ, UNC,. Dirección del Dr. Marcelo M. Mariscal.
  3. F. Gutiérrez, «Simulación Numérica de Procesos Reactivos en Mezcla de Gases con Múltiples Componentes». Tesis Doctoral Cs. de la Ingeniería, FCEFyN, UNC,. Dirección del Dr. José Tamagno.
  4. J.L. Borioni, «Estudios Computacionales de Sistemas Orgánicos y Bioorgánicos» Dpto. Química orgánica, Fac. Cs. Qcas, INFIQC (CONICET), marzo 2016. Dirección de la Dra. Adriana B. Pierini.
  5. P. Benítez-Llambay, «Interacciones Planeta Disco. Desarrollo y utilización de un código numérico», Tesis Doctoral en Astronomía, FaMAF, UNC, 2015. Dirección del Dr. Frédéric Masset y Co-Dirección del Dr. Cristián Beaugé.
  6. E. Daiann Sosa Carrizo, “Estudios Computacionales en Catálisis Homogénea con Metales de Transición: Reacción de Stille, Activación de Enlaces C-H y β-Eliminación” , Tesis Doctoral en Ciencias Químicas, FCQ, UNC. marzo 2016. Dirección de la Dra. Sandra E. Martín.
  7. E.N. Millán, «Implementación de problemas masivamente paralelos sobre Unidades de Procesamiento Gráfico (GPUs)», Doctorado en Ciencias de la Computación, UNSL, 2016. Dirección del Dr. Eduardo M. Bringa y María Fabiana Piccoli.
  8. F. Carrasco, «Aplicaciones analíticas y numéricas de la teoría de ecuaciones en derivadas parciales a ciertos problemas de evolución sobre espacios curvos». Tesis Doctoral en Física, FaMAF, UNC, 2016. Dirección del Dr. Oscar Reula.
  9. N.B. Caballero, «Estudio de Fases Vitreas en Cristales Moleculares», Tesis Doctoral en Física, FaMAF, UNC, 23 de marzo 2016. Dirección del Dr. Pablo Serra y co-direccción del Dr. Mariano Zuriaga.

2016 Tesis de Maestría

  1. Mariano Arselán, Lucía Reviglio, Francisco Malano, «Paralelización de simulador de proyecciones radiográficas basadas en PENELOPE», Maestría en Análisis y Procesamiento de Imágenes, UNC, 7 julio 2016. Dirección del Dr. Mauro Valente.

2016 Trabajos Finales y Tesinas

  1. M. Broens, «Comportamiento de nanoestructuras de ZnO bajo estrés mecánico». Trabajo Especial de la Licenciatura en Química, FCQ, UNC, 2016. Dirección del Dr. Germán Soldano y codirección del Dr. Marcelo Mariscal.
  2. N.A.E. Moyano, «Estructura Molecular de la Interfase entre Líquidos Iónicos Inmiscibles». Tesina de Lic. en Física, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, UNCUYO. Finalizada 2016. Dirección: M. G. Del Pópolo.

2015 Producción cientifica

  1. B.D. Howes, L. Boechi, A. Boffi, D.A. Estrin, G. Smulevich. «Bridging Theory and Experiment to Address Structural Properties of Truncated Haemoglobins: Insights from Thermobifida fusca HbO.» In Advances in microbial physiology, vol. 67, pp. 85-126. Academic Press, 2015.
  2. S.A. Bieza, F. Boubeta, A. Feis, G. Smulevich, D.A. Estrin, L. Boechi, S.E. Bari. «Reactivity of Inorganic Sulfide Species toward a Heme Protein Model.» Inorganic chemistry 54 (2), 527-533 (2015).
  3. D. Giordano, A. Pesce, L. Boechi, J.P. Bustamante, E. Caldelli, B.D. Howes, A. Riccio, G. Di Prisco, M. Nardini, D.A. Estrin, G. Smulevich, M. Bolognesi, C. Verde. «Structural flexibility of the heme cavity in the cold adapted truncated hemoglobin from the Antartic marine bacterium Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125.» FEBS Journal 282 (15), 2948-2965 (2015).
  4. E. Cuevasanta, A. Zeida, S. Carballal, R. Wedmann, U.N. Morzan, M. Trujillo, R. Radi, D.A. Estrin, M.R. Filipovic, B. Alvarez. «Insights into the mechanism of the reaction between hydrogen sulfide and peroxynitrite.» Free Radical Biology and Medicine 80, 93-100 (2015).
  5. J.P. Arcon, P. Rosi, A.A. Petruk, M.A. Marti, D.A. Estrin. «Molecular Mechanism of Myoglobin Autoxidation: Insights from Computer Simulations.» The Journal of Physical Chemistry B 119 (5), 1802-1813 (2015).
  6. I. Boron, J.P. Bustamante, K.S. Davidge, S. Singh, L.A.H. Bowman, M. Tinajero-Trejo, S. Carballal, R. Radi, R.K. Poole, K. Dikshit, D.A. Estrin, M.A. Marti, L. Boechi. «Ligand uptake in Mycobacterium tuberculosis truncated hemoglobins is controlled by both internal tunnels and active site water molecules.» F1000Research 4 (2015).
  7. I. Boron, L. Capece, F. Pennacchietti, D.E. Wetzler, S. Bruno, S. Abbruzzetti, L. Chisari, F.J. Luque, C. Viappiani, M.A. Marti, D.A. Estrin, A.D. Nadra. «Engineered chimeras reveal the structural basis of hexacoordination in globins: A case study of neuroglobin and myoglobin.» BBA Gen. Subjects, 1850, 169-177 (2015).
  8. G.L. Borosky, K.K. Laali, «In silico study on chemical properties and reactivity of enal derivatives.» European Journal of Organic Chemistry 2015, no. 30 (2015): 6615-6623.
  9. O.A. Oviedo, P. Vélez, V.A. Macagno, E.P.M. Leiva, «Underpotential deposition: From planar surfaces to nanoparticles», Surface Science 631 (2015) 23–34, ISSN: 0039-6028.
  10. M.E. Zoloff Michoff, M.E. Castillo, E.P.M. Leiva, «Mechanical Effects on the Electronic Properties of a Biphenyl-Based Molecular Switch», J. Phys. Chem. C, 2015, 119(2015) 5090–5097.
  11. S.A. Paz, E.P.M. Leiva, «Time Recovery for a Complex Process Using Accelerated Dynamics», J. Chem. Theory Comput., 2015, 11 (4), pp 1725–1734.
  12. G.E. Jara, C.A. Solis, N.S. Gsponer, J.J. Torres, C.A. Glusko, C.M. Previtali, A.B. Pierini, D.M.A. Vera, C.A. Chesta, H.A. Montejano «An experimental and TD-DFT theoretical study on the photophysical properties of Methylene Violet Bernthsen», Dyes and Pigments 112, 341-351 (2015)
  13. W.D. Guerra, R.A. Rossi, A.B. Pierini, S.M. Barolo, «Metal Free Synthesis of Carbazoles by Photostimulated Reactions of 2′- Halo-[1,1′-biphenyl]-2-amines», J. Org. Chem. 80, 928–941 (2015)
  14. L.E. Peisino, G.P. Camargo Solorzano, M.E. Budén, A.B. Pierini,  «Iterative double cyclization reaction by SRN1 mechanism. A theoretical interpretation of the regiochemical outcome of diazaheterocycles», RSC Advances 5, 36374 – 36384 (2015)
  15. M.E. García, J.L. Borioni, V. Cavallaro, M. Puiatti, A.B. Pierini, A.P. Murray, A.B. Peñéñory, «Solanocapsine derivatives as potential inhibitors of acetylcholinesterase: synthesis, molecular docking and biological studies», Steroids 104, 95-110 (2015)
  16. C.A. Menéndez, S.R. Accordino, D.C. Gerbino, G.A. Appignanesi, «‘Chameleonic’ backbone hydrogen bonds in protein binding and as drug targets», European Physical Journal E 38, 107 (2015).
  17. S.R. Accordino, J.M. Montes de Oca, J.A. Rodriguez Fris and G.A. Appignanesi, «Hydrophilic behavior of graphene and graphene-based materials», Journal of Chemical Physics 143, 154704 (2015).
  18. G.J. Soldano, F.M. Zanotto, M.M. Mariscal, «Mechanical stability of zinc oxide nanowires under tensile loading: is wurtzite stable at the nanoscale?»,  RSC Adv., Vol 5, 43563–43570, 2015.
  19. L.D. Álvarez, M.V. Dansey, D.Y. Grinman, D. Navalesi, G.A. Samaja, M.C. Del Fueyo, N. Bastiaensen, R. Houtman, D.A. Estrin, A.S. Veleiro, A. Pecci, G. Burton, «Destabilization of the torsioned conformation of a ligand side chain inverts the LXRβ activity», (2015) Biochimica et Biophysica Acta – Molecular and Cell Biology of Lipids, 1851 (12), pp. 1577-1586.
  20. A. Zeida, A.M. Reyes, P. Lichtig, M. Hugo, D.S. Vazquez, J. Santos, F.L. González Flecha, R. Radi, D.A. Estrin, M. Trujillo, «Molecular Basis of Hydroperoxide Specificity in Peroxiredoxins: The Case of AhpE from Mycobacterium tuberculosis», (2015) Biochemistry, 54 (49), pp. 7237-7247.
  21. L.D. Álvarez, D.A. Estrin, «Exploring the molecular basis of neurosteroid binding to the β3 homopentameric GABA<inf>A</inf> receptor», (2015) Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology, 154, art. no. 4450, pp. 159-167.
  22. E.N. Millán, S.B. Goirán, M.F. Píccoli, C. García Garino, J.N. Aranibar, E.M. Bringa, «Monte Carlo simulations of settlement dynamics in GPUs», Cluster Computing, volume 19 number 1, doi 10.1007/s10586-015-0501-5, 2015, pp 557–566.
  23. E.N. Millán, C.S. Bederián, M.F. Píccoli, C. García Garino, E.M. Bringa, «Performance Analysis of Cellular Automata HPC Implementations». Comput. Electr. Eng., Volume 48, number C, doi 10.1016/j.compeleceng.2015.09.015, 2015, pp 12–24.
  24. D.J. Paz, A.G. Sánchez, «Improving the precision matrix for precision cosmology», Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Volume 454, Issue 4, p.4326-4334, 2015.
  25. N. Giri, M.G. Del Pópolo, G. Melaugh, R.L. Greenaway, K. Rätzke, T. Koschine, M.F. Costa Gomes, L. Pison, A.I. Cooper, S.L. James, “Liquids with permanent porosity», Nature, 527, (2015), 216-220.
  26. G.L. Borosky, K.K. Laali, “In silico study on chemical properties and reactivity of enal derivatives”, European Journal of Organic Chemistry, en prensa.
  27. F. Gutiérrez, J. Tamagno, S. Elaskar, «RANS Simulation of Turbulent Diffusive Combustion Using openFoam», Journal of Appplied Fluid Mechanics, Vol. 9 Num. 2, March 2016.
  28. S. Perez, M. Zuriaga, P. Serra, A. Wolfenson, P. Negrier, J. Tamarit, «Dynamic characterization of crystalline and glass phases of deuterated 1,1,2,2 Tetrachloroethan», Journal of Chemical Physics, 143, 134502, 2015.
  29. C.E. Budde, P.R. D’Argenio, H. Hermanns, «Rare event simulation with fully automated importance splitting», Computer Performance Engineering, 9272 (pp. 275-290), 2015.
  30. R.D. Porasso, N.M. Ale, F. Ciocco Aloia, D. Masone, M.G. Del Pópolo, A. Ben Altabef, A. Gomez-Zavaglia, S.B. Diaz, J.A. Vila, “Interaction of Glycine, Lysine, Proline and Histidine with Dipalmitoylphosphatidylcholine Lipid Bi- layers: a Theoretical and Experimental Study», RSC Adv., 5, 43537, 2015.
  31. F. Gutiérrez, J. Tamagno, S. Elaskar, «Assessment of openFoam Solvers in Aerospace Applications», 1st Pan-American Congress on Computational Mechanics – PANACM/XI Argentine Congress on Computational Mechanics – MECOM 2015.
  32. E. Daiann Sosa Carrizo, I. Fernández, S.E. Martín, «Computational Study on the C−Heteroatom Bond Formation via Stille Cross-Coupling Reaction: Differences between Organoheterostannanes Me3SnAsPh2 vs Me3SnPPh2». Organometallics 2015, 34, 159−166.
  33. P.R. Zangara, D. Bendersky, H.M. Pastawski, «Proliferation of effective interactions: Decoherence-induced equilibration in a closed many-body system», Phys. Rev. A 91, 042112, 2015.
  34. F.A. Soria, P. Paredes-Olivera, E.M. Patrito, «Chemical stability towards O2 and H2O of Si(111) grafted with -CH3, -CH2CH2CH3, -CHCHCH3 and -CCCH3«. J. Phys. Chem. C. 2015, 119, 284–295 DOI: 10.1021/jp508728v.
  35. M.C. Gimenez, L. Reinaudi and E.P.M. Leiva, «Monte Carlo simulation of elongating metallic nanowires in the presence of surfactants», The Journal of Chemical Physics 143, no. 24 (2015): 244702.

2015 Vinculación del CCAD

Grupo Telecom

Grupo-Telecom_logo-fb

Capacitación en MPP (Procesadores Paralelos Masivos) para un grupo de 20 personas. Ocho clases de cuatro horas con asistencia de empleado

2015 Cursos para la Comunidad

  1. Fernando Gleiser, «Diagnosticando problemas de desempeño en Linux«, 26 de Octubre de 2015 en FaMAF-UNC.

2015 Tesis de Doctorado

  1. P.R. Zangara, «El eco de Loschmidt en sistemas de espines: decoherencia, equilibración, localización y mecanismos emergentes de irreversibilidad», Tesis Doctoral en Física, FaMAF, UNC, diciembre de 2015. Dirección del Dr. Horacio M. Pastawski.
  2. A. Zeida, «Estructura y mecanismo de acción de peroxirredoxinas: estudio teórico y experimental», FCEN, UBA, diciembre 2015. Dirección del Dr. Darío Estrin.
  3. J.P. Bustamante, «Estudio fisicoquímico y bioinformático de la familia de hemoglobinas truncadas», FCEN, UBA, noviembre 2015. Dirección del Dr. Darío Estrin.
  4. M.S. Moyano, «Simulaciones Estocásticas de Tejidos Biológicos» , Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, UNCUYO (en desarrollo), 2015. Dirección del Dr. M. G. Del Pópolo.
  5. N. Rosner, «Técnicas distribuidas para verificación exhaustiva acotada», Tesis Doctoral en Ciencias de la Computación, FCEyN, UBA (en desarrollo), 2015. Dirección del Dr. Marcelo Frías.
  6. J. Saldía, «Diseño y desarrollo de un código de alto rendimiento para la simulación numérica de flujos hipersónicos reactivos». Tesis Doctoral en Cs. de la Ingeniería, FCEFyN, UNC, 2015. Dirección del Dr. Sergio Elaskar.
  7. J.G. Martí, «Modelos de formación planetaria y resonancias múltiples», Tesis Doctoral en Astronomía, FaMAF, UNC, 2015. Dirección del Dr. Cristián Beaugé.

2015 Trabajos Finales y Tesinas

  1. M.I. Taccone, «Propiedades de Nanoestructuras Semiconductoras con Aplicaciones en Celdas Solares» Trabajo Especial de la Licenciatura en Química, FCQ, UNC, 2015. Dirección del Dr. Germán Soldano y codirección del Dr. Marcelo Mariscal.
  2. M.H. Pérez, «Paralloy: Learning y Restarts en un SAT-Solver distribuido», Tesis de Licenciatura en Ciencias de la Computación, FCEyN, UBA, 2015 (en desarrollo). Dirección del Lic. Nicolás Rosner y Lic. Ignasio Vissani (UBA). – Se espera defender en 2015.
  3. S. Metz, «Estudio computacional de la hidrólisis enzimática de tres profármacos Anti – HIV», Tesina de Licenciado en Bioinformática, Fac. Ingeniería, Universidad Nacional de Entre Ríos (FI-UNER), 2015. Dirección del Dr. Mario Alfredo Quevedo (UNC).

2014 Producción cientifica

  1. L.M. Alarcón, J.M. Montes de Oca, S.A. Accordino, J.A. Rodriguez Fris, G.A. Appignanesi, «Hydrophobicity and geometry: water at curved graphitic-like surfaces and within model pores in self-assembled monolayers», Fluid Phase Equilibria 362 81-86 (2014).
  2. J.M. Montes de Oca, J.A. Rodriguez Fris, G.A. Appignanesi, A. Fernández, «Productive induced metastability in allosteric modulation of kinase function», FEBS J 281, 3079 (2014).
  3. J.A. Rodriguez Fris, M.A. Frechero, G.A. Appignanesi, «Relaxation pathway confinement in glassy dynamics», J. Chem. Phys. 141, 114905 (2014).
  4. R.J. Wehmschulte, K. K. Laali, G. L. Borosky, D. R. Powell,“Synthesis and structure of the first bridgehead silylium ion”, Organometallics 2014, 33, 2146-2149.
  5. A. Jamalian, B. Rathman, G.L. Borosky, K.K. Laali, “Catalytic, regioselective, and green methods for rearrangement of 1,2-diaryl epoxides to carbonyl compounds employing metallic triflates, Brønsted-acidic ionic liquids (ILs), and IL/microwave; experimental and computational substituent effect study on aryl versus hydrogen migration”, Applied Catalysis A – General 2014, 486, 1-11.
  6. G.L. Borosky, “Catalytic activity of human placental alkaline phosphatase (PLAP): insights from a computational study”, Journal of Physical Chemistry B 2014, 118, 14302-14313.
  7. G. Melaugh, N. Giri, C.E. Davidson, S.L. James, M.G. Del Pópolo, “Designing and Understanding Intrinsic Microporsity in Liquids». Phys. Chem. Chem. Phys., 16, (2014), 9422-9431.
  8. I.M. Ragessi, S. Márquez Damián, N. Guillen, C. Pozzi Piacenza, C.M. García, G. Hillman, “Validación de un modelo numérico para la caracterización hidráulica de las obras de evacuación de la presa los molinos – Jujuy.”, XXI Congreso sobre Métodos Numéricos y sus Aplicaciones (ENIEF 2014), septiembre 2014.
  9. C. Pozzi Piacenza, S. Márquez Damián, H. Herrero, I.M. Ragessi, P. Furlan y C.M. García, “Evaluación de simulaciones numéricas bi y tridimensionales del flujo en una confluencia fluvial”. XXI Congreso sobre Métodos Numéricos y sus Aplicaciones (ENIEF 2014), septiembre 2014.
  10. L.E.F. Foa Torres, P.M. Perez-Piskunow, C.A. Balseiro, G.Usaj, «Multiterminal Conductance of a Floquet Topological Insulator «, Phys. Rev. Lett. 113, 266801 (2014).
  11. E.P.M. Leiva, M. Otero, C.B. Robledo, L. Reinaudi, G.L. Luque, O.R. Cámara, M.I. Rojas, “Computer modeling of materials for Li-ion battery anodes”, 65th Meeting of the International Society of Electrochemistry, August 31 to September 5, 2014, Lausanne, Suiza.
  12. A. Sigal, M. Villarreal, M.I. Rojas, E.P.M. Leiva, “A new model for the prediction of oxygen interference in hydrogen storage systems”, International Journal of Hydrogen Energy, 39 5899-5905 (2014). http://dx.doi.org/10.1016/j.ijhydene.2014.01.175
  13. C.B. Robledo, M.I. Rojas, O. Cámara, E.P.M. Leiva, “First-Principles Studies Concerning Optimization of Hydrogen Storage in Nanoporous Reduced Graphite Oxide”, International Journal of Hydrogen Energy, 39 4396-4403 (2014). http://dx.doi.org/10.1016/j.ijhydene.2013.12.206
  14. C.B. Robledo, M. Otero, G. Luque, O. Cámara, D. Barraco, E.P.M. Leiva, M.I. Rojas, “First-Principles Studies of Lithium Storage in Reduced Graphite Oxide”, Electrochimica Acta, 140 232-237 (2014). http://dx.doi.org/doi:10.1016/j.electacta.2014.07.013
  15. F. Cometto, C. Calderón, M. Moran, G. Ruano, H. Ascolani, G. Zampieri, P. Paredes-Olivera, E.M. Patrito, «Formation, Characterization and Stability of Methyl Selenolate Monolayers on Au(111). An Electromechanical, High Resolution Photoemission Spectroscopy and DFT Study», Langmuir 2014, 30, 3754-3763.
  16. E.E. Ferrero, A.B. Kolton, M. Palassini, «Parallel kinetic Monte Carlo simulation of Coulomb Glasses», Proceedings of the TIDS15 Conference, September 2013, Journal-ref: AIP Conf. Proc. 1610, 71 (2014), DOI: 10.1063/1.4893513
  17. H.D. Pasinato, «Direct Numerical Simulation (DNS) of fully developed turbulent channel flow with heat transfer for moderately high Reynolds numbers», Mecánica  Computacional,  XXXIII, Eds. G. Bertolino et al., pp. 287-297, 2014.
  18. J.A.A. Barbosa, A. Zoppi, M.A. Quevedo, P.N. de Melo, A.S.A. de Medeiros, L. Streck, A.R. de Oliveira, M.F. Fernandes-Pedrosa, M.R. Longhi, A.A. da Silva-Júnior, «Triethanolamine Stabilization of Methotrexate-β-Cyclodextrin Interactions in Ternary Complexes», International Journal of Molecular Sciences 01/2014; 15(9):17077-17099. DOI: 10.3390/ijms150917077.
  19. M.A. Quevedo, S.R. Ribone, M.C. Briñón, W. Dehaen, «Development of a receptor model for efficient in silico screening of HIV-1 integrase inhibitors». J. Mol. Graph. Model. 2014, 52 (0), 82-90.
  20. A.C. Kogawa, A. Zoppi, M.A. Quevedo, H.R. Nunes Salgado, M.R. Longhi, «Increasing Doxycycline Hyclate Photostability by Complexation with β-Cyclodextrin». AAPS PharmSciTech 2014.
  21. S. Ravetti, C. De Candia, M. S. Gualdesi, S. Pampuro, G. Turk, M.A. Quevedo and C.M. Briñón, «Biological evaluation and molecular modelling of didanosine derivatives», MedChemComm 5, no. 5 (2014): 622-631., DOI: 10.1039/C4MD00003J, Concise Article.

2014 Tesis de Doctorado

  1. L. Peisino, «Diseño de nuevas estrategias sintéticas en química orgánica mediante reacciones de transferencia de electrones», Dpto. Química orgánica, Fac. Cs. Qcas, INFIQC (CONICET), diciembre 2014. Dirección de la Dra. Adriana B. Pierini.
  2. M.A. Via, «Transporte de proteinas y nanopartículas a través de biomembranas inducido por péptidos de penetración celular», Instituto de Histología y Embriología de Mendoza (IHEM) y Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, UNCUYO (en desarrollo), 2014. Dirección del Dr. M.G. Del Pópolo.

2014 Vinculación del CCAD

SG16 Team

2014-12-04_DarioEnElTaller
Dario Gra#a en el Taller probando el auto de Mariano Werner.

Proveedores de autos de competición para la marca Fiat en el Super TC2000.
Se asesoró en la compra, instalación, puesta a punto y optimización de un servidor de cálculo (4*AMD 6376, 256 GiB RAM) para realizar Dinámica de Fluídos Computacional (CFD) en modelos de la carrocería del Fiat Línea.

Se instaló un entrorno idéntico al Cluster Mendieta, y se compiló OpenFOAM con optimizaciones particulares para la arquitectura Abu Dhabi de AMD.

2013 Producción cientifica

  1. N. Paccioni, A.B. Pierini, A.V. Veglia, «Structural Characterization of N-methylcarbamate:β-cyclodextrin Complexes by Experimental Methods and Molecular Dynamics Simulations», Spectrochimica Acta A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy 103, 319–324 (2013).
  2. V.B. Dorn, G. F. Silbestri, M.T. Lockhart, A.B. Chopa, A.B. Pierini, «Influence of structural features of tri-functionalized aryl phosphates on the outcome of the SRN1 process with stannyl anions: a DFT study», New J. Chem. 37, 1150-56 (2013).
  3. K.F. Crespo Andrada, L.E. Peisino, A. Daştan, M. Güney, A.B. Pierini, «Nucleophilic Substitution of Bromonorbornenes and Derivatives by Electron Transfer Reactions», Organic & Biomolecular Chemistry 11, 955-65 (2013).
  4. L.E. Peisino, A.B. Pierini, «Experimental and Computational Study of 6-exo and 7-endo Cyclization of Aryl Radicals Followed by Tandem SRN1 Substitution», J. Org. Chem. 78(10), 4719–4729 (2013).
  5. G.E. Jara, D.M.A. Vera, A.B. Pierini, «Binding of modulators to mouse and human multidrug resistance P-glycoprotein. A computational study», Journal of Molecular Graphics and Modelling, 46, 10-21 (2013).
  6. M. Puiatti, J.L. Borioni, M. Vallejo, J.L. Cabrera, M. Agnese, M.G. Ortega, A.B. Pierini, «Study of the interaction of Huperzia saururus Lycopodium alkaloids with the Acetylcholinesterase enzyme», Journal of Molecular Graphics and Modelling, 44, 136-144 (2013)
  7. M. Defonsi Lestard, S. Díaz, M. Puiatti, G. Echeverría, O. Piro, A.B. Pierini, A. Ben Altabef, M.E. Tuttolomondo, «Vibrational and Structural Behavior of L-Cysteine Ethyl Ester.HCl in the Solid State and in Aqueous Solution», J. Phys. Chem A 117, 14243-14252 (2013)
  8. D. Masone, F. Ciocco, M.G. Del Pópolo, “H-bond refinement for electron transfer membrane-bound protein-protein complexes: cytochrome c oxidase and cytochrome c552″, Comp. Biol. and Chem. 47, 31-36 (2013).
  9. F.A. Soria, E.M. Patrito, P. Paredes-Olivera, «Tailoring the Surface Reactivity of Silicon Surfaces by Partial Halogenation», J. Phys. Chem. C, 2013, 117, 18021–18030.
  10. E.E. Ferrero, S. Bustingorry, A.B. Kolton, A. Rosso, «Numerical Approaches on Driven Elastic Interfaces in Random Media», Comptes Rendus Physique, Volume 14, Issue 8, Pages 641-650 (2013), DOI: 10.1016/j.crhy.2013.08.002
  11. E.E. Ferrero, S. Bustingorry, A.B. Kolton, «Non-steady relaxation and critical exponents at the depinning transition», Phys. Rev. E 87, 032122 (2013), DOI: 10.1103/PhysRevE.87.032122
  12. G.L. Luque, M.I. Rojas, E.P.M. Leiva, “Curvature Effect in the Longitudinal Unzipping Carbon Nanotubes”, Journal of Solid Electrochemical 17 1189-1200 (2013). ISSN: 1432-8488 (Print) 1433-0768 (Online).
  13. C.B. Robledo, M. Otero, G. Luque, O. Cámara, D. Barraco, E.P.M. Leiva, M.I. Rojas. “First-Principles Studies of Lithium Storage in Reduced Graphite Oxide” to appear Electrochimica Acta. ISSN: 0013-4686 Pergamon-Elsevier Science LTD.
  14. C.B. Robledo, M.I. Rojas, O. Cámara, E.P.M. Leiva. «First-Principles Studies Concerning Optimization of Hydrogen Storage in Nanoporous Reduced Graphite Oxide», International Journal of Hydrogen Energy, to appear, 2013.
  15. M. Sgró, D. Paz, M. Merchán, «Anisotropic halo model: implementation and numerical results», Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Volume 433, Issue 1, p.787-795.
  16. A.C. Kogawa, A. Zoppi, M.A. Quevedo, M.R. Longhi, H.R.N. Salgado, “Complexation between darunavir ethanolate and β-cyclodextrin”, 9th International Congress of Pharmaceutical Sciences, 20 al 23 de noviembre de 2013, Riberão Preto, Brasil.
  17. M.A. Quevedo, M.S. Gualdesi, M.C. Briñón, “Diseño computacional de nuevos derivados de didanosina con afinidad selectiva por la enzima nucleotidasa”, XIX Simposio Nacional de Química Orgánica, Sociedad Argentina de Investigación en Química Orgánica (SAIQO). 16 al 19 de noviembre de 2013, Mar del Plata, Argentina.
  18. S.R. Ribone, E.M. Schenfeld, M. Madrid, M.C. Briñón, M.A. Quevedo, “Diseño computacional de nuevos inhibidores de la integrasa del VIH. Interacción entre LEDGF/P75 y dicha enzima”, XIX Simposio Nacional de Química Orgánica, Sociedad Argentina de Investigación en Química Orgánica (SAIQO). 16 al 19 de noviembre de 2013, Mar del Plata, Argentina.
  19. E.N. Millán, P.C. Martinez, V. Gil Costa, M.F. Piccoli, M. Printista, C.S. Bederián, C. García Garino, E.M. Bringa, «Parallel implementation of a Cellular Automata in a hybrid CPU/GPU environment», XIX Congreso Argentino de Ciencias de la Computación 2013 (CACIC), Mar del Plata, Buenos Aires. ISBN-978-987-23963-1-2. Octubre 2013.
  20. E.N. Millán, C. Ringl, C.S. Bederián, M.F. Piccoli, C. García Garino, H.M. Urbassek, E.M. Bringa, «A GPU implementation for improved granular simulations with LAMMPS», VI Latin American Symposium on High Performance Computing (HPCLatAm 2013). ISBN en trámite. 29 de Julio del 2013, Mendoza, Argentina.
  21. G. Ares, P. Ezzatti, E. Quintana-Ortí, «Towards a Distributed GPU-Accelerated Matrix Inversion», VI Latin American Symposium on High Performance Computing (HPCLatAm), Mendoza, Argentina. 2013.
  22. V.C. Fuertes, C.F.A. Negre, M.B. Oviedo, F.P. Bonafé, F.Y. Oliva, C.G Sánchez, «A theoretical study of the optical properties of nanostructured TiO(2)», Journal of Physics Condensed Matter 03/2013; 25(11):115304.
  23. R. Onnainty, E.M. Schenfeld, M.A. Quevedo, M.A. Fernández, M.R. Longhi, G.E. Granero, “Characterization of the hydrochlorothiazide: β-cyclodextrin inclusion complex. Experimental and theoretical methods”, Journal of Physical Chemistry B,  (2013), 117, 206-217.

2013 Tesis de Doctorado

  1. M.B. Oviedo. «Dinámica cuántica de sistemas moleculares complejos en tiempo real», Phd Thesis. Facultad de Ciencias Químicas, Universidad Nacional de Córdoba, diciembre 2013. Dirección del Dr. Cristian G. Sánchez.
  2. N.V. Torres, «Síntesis de poliarilos. Estructura y reactividad de radicales aniones intermediarios» Dpto. Química orgánica, Fac. Cs. Qcas, INFIQC (CONICET), marzo 2013. Dirección de la Dra. Adriana B. Pierini.

2012 Producción cientifica

  1. F.A. Soria, E.M. Patrito, P. Paredes-Olivera, «Oxidation of Hydrogenated Si(111) by a Radical Propagation Mechanism», J. Phys. Chem. C, 2012, 116 (46), pp 24607–24615.
  2. F.P. Cometto, P. Paredes Olivera, E.M. Patrito, G. Zampieri, H. Ascolani, «Electrochemical, High-Resolution Photoemission Spectroscopy and VDW-DFT Studt of the Thermal Stability of Benzenethinol and Benzeneselenol Monolayers on Au(111)», Langmuir 2012, 28, 13624-35.
  3. M.S. Gualdesi, M.C Briñón, M.A. Quevedo.“Intestinal Permeability of Lamivudine (3TC) and two Novel 3TC Prodrugs. Experimental and Theoretical Analyses”. European Journal of Pharmaceutical Sciences, (2012), 47, 965-978.
  4. M.B. Oviedo, X. Zarate, C.F.A. Negre, E. Schott, R. Arratia-Pérez, B. Oviedo, C.G. Sánchez: Quantum Dynamical Simulations as a Tool for Predicting Photoinjection Mechanisms in Dye-Sensitized TiO2 Solar Cells. Journal of Physical Chemistry Letters 08/2012; 3:2548.
  5. C.F.A. Negre, V.C. Fuertes, M.B. Oviedo, F.Y. Oliva, C.G. Sánchez: Quantum Dynamics of Light-Induced Charge Injection in a Model Dye–Nanoparticle Complex. The Journal of Physical Chemistry C. 06/2012.