Actualizamos los clusters más viejos con el software más nuevo posible. Una segunda y última vida a Mulatona y Eulogia, que gracias a las actualizaciones mejoraron su desempeño en aplicaciones muy usadas como Quantum Espresso.
Mulatona y Eulogia son nuestros clusters más viejos. Mulatona es algo asi como modelo 2016 y Eulogia 2018. Teniendo en cuenta que los clusters empiezan a calentar más de lo que producen al cabo de 5-8 años, ambos están en el periodo final de su vida útil (EOL).
En vez de dejar que se vuelvan inoperativos por potencia de cómputo, ancho de banda a memoria y stack de software obsoleto, hicimos lo que pudimos con el capital más importante que tenemos, los recursos humanos.
En enero y febrero baja mucho la demanda computacional por las vacaciones de verano, y por eso el CPA Principal de IFEG-CONICET, Carlos Bederián, aprovechó para reinstalar de cero, primero Mulatona y luego Eulogia.
El resultado fue que Mulatona pasó a Rocky Linux release 9.1 (Blue Onyx) y eso implica un Linux kernel@5.14 y un compilador gcc@11.3.1 de base. Sobre esto y usando Spack se compiló e instaló compiladores aun más nuevos: gcc@12.2.0 intel@2021.8.0 y oneapi@2023.0.0. Mulatona, la más vieja de todas tiene el stack de sistema operativo, bibliotecas base y compiladores más nuevos de todo el CCAD. Si la Ley de Proebsting se cumple, tendremos mejoras importantes en la eficiencia del código emitido por estos compiladores.
Eulogia siempre fue/es/será un caso especial. La arquitectura KNL tiene sus bemoles, no tanto en la instalación del sistema base, sino en la elección del compilador. Intel volvió obsoleta la arquitectura Knights Landing desde agosto de 2021 para sus compiladores y GCC no emite tan buen código de máquina como Intel en KNL. Para que intel@2021 funcione se necesitaba correr en Rocky Linux release 8.7 (Green Obsidian). Aunque Bederián trabajó para que corra en Blue Onyx, no hubo caso y tuvo que volver atrás una versión. Esto implicó que Eulogia, por más que es una arquitectura dos años más joven que Mulatona, requiera de software más viejo para poder correr y más del doble de trabajo. La lección ya la conocemos: arquitecturas raras, problemas por todos lados.
De todas maneras pruebas preliminares con QE@7.1 compilado con intel@2021 muestran una mejora de entre 2x y 3x respecto a la instalación anterior.
En ambos casos se necesitaron drivers del kernel para las placas InfiniBand QDR, y aunque estas placas tienen un excelente desempeño tanto en ancho de banda como en latencia, no están soportados por ninguna distribución de Linux actual. La placa MT26428 es hardware que salió en 2010. La comunidad siempre presente, esta vez a través de El Repo, le permitió a Bederián tener drivers de las versiones de Linux kernel correspondientes para estas placas obsoletas en software, pero tremendamente útiles en sus prestaciones.
Cuando pasan estas cosas, siempre se me viene a la cabeza la viñeta que la artista Christiann Macauley publicó en su sitio Sticky Comics.
por Nicolás Wolovick, Director del CCAD-UNC
